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김상욱
김상욱 (Sanguk Kim) 저자 이메일 보기
POSTECH
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  CV updated 2020-11-02 14:12
 
조회 313  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Single-cell RNA sequencing identifies shared differentiation paths of mouse thymic innate T cells
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Invariant natural killer T (iNKT), mucosal-associated invariant T (MAIT), and γδ T cells are innate T cells that acquire memory phenotype in the thymus and share similar biological characteristics. However, how their effector differentiation is developmentally regulated is still unclear. Here, we identify analogous effector subsets of these three innate T cell types in the thymus that share transcriptional profiles. Using single-cell RNA sequencing, we show that iNKT, MAIT and γδ T cells mature via shared, branched differentiation rather than linear maturation or TCR-mediated instruction. Simultaneous TCR clonotyping analysis reveals that thymic maturation of all three types is accompanied by clonal selection and expansion. Analyses of mice deficient of TBET, GATA3 or RORγt and additional in vivo experiments corroborate the predicted differentiation paths, while human innate T cells from liver samples display similar features. Collectively, our data indicate that innate T cells share effector differentiation processes in the thymus.

논문정보
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2020년 후보
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 08월 (BRIC 등록일 2020-09-01)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genomics, Genetics, Systems Biology
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