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김선욱 (Sun-Uk Kim) 저자 이메일 보기
한국생명공학연구원
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Prediction-based highly sensitive CRISPR off-target validation using target-specific DNA enrichment
열기 Authors and Affiliations

Abstract

CRISPR effectors, which comprise a CRISPR-Cas protein and a guide (g)RNA derived from the bacterial immune system, are widely used for target-specific genome editing. When the gRNA recognizes genomic loci with sequences that are similar to the target, deleterious mutations can occur. Off-target mutations with a frequency below 0.5% remain mostly undetected by current genome-wide off-target detection techniques. Here we report a method to effectively detect extremely small amounts of mutated DNA based on predicted off-target-specific amplification. In this study, we used various genome editors to induce intracellular genome mutations, and the CRISPR amplification method detected off-target mutations at a significantly higher rate (1.6~984 fold increase) than an existing targeted amplicon sequencing method. In the near future, CRISPR amplification in combination with genome-wide off-target detection methods will allow detection of genome editor-induced off-target mutations with high sensitivity and in a non-biased manner.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 07월 (BRIC 등록일 2020-07-20)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biotechnology, Biochemistry, Genetics
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김현민
발표: 김현민 (KAIST)
일자: 2020년 9월 29일 (화) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
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