[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 sale 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
산으로 가는 전공 이야기
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 한빛사논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
박한범 (Hahnbeom Park) 저자 이메일 보기
University of Washington
저자CV 보기
122 KB
조회 958  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
High‐accuracy refinement using Rosetta in CASP13
열기 Authors and Affiliations


Because proteins generally fold to their lowest free energy states, energy‐guided refinement in principle should be able to systematically improve the quality of protein structure models generated using homologous structure or co‐evolution derived information. However, because of the high dimensionality of the search space, there are far more ways to degrade the quality of a near native model than to improve it, and hence, refinement methods are very sensitive to energy function errors. In the 13th Critial Assessment of techniques for protein Structure Prediction (CASP13), we sought to carry out a thorough search for low energy states in the neighborhood of a starting model using restraints to avoid straying too far. The approach was reasonably successful in improving both regions largely incorrect in the starting models as well as core regions that started out closer to the correct structure. Models with GDT‐HA over 70 were obtained for five targets and for one of those, an accuracy of 0.5 å backbone root‐mean‐square deviation (RMSD) was achieved. An important current challenge is to improve performance in refining oligomers and larger proteins, for which the search problem remains extremely difficult.

Keywords : energy function, homology modeling, protein conformational search, rotein structure prediction

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 12월 (BRIC 등록일 2020-01-28)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Biochemistry, Molecular_Biology, Biophysics
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: Koehl P: F1000Prime Recommendation of [Park H et al., Proteins 2019 87(12):1276-1282]. In F1000Prime, 15 Jan 2020; 10.3410/f.736228324.793569318
Dot/Icm 제 4 유형 커플링 단백질 복합체의 선택적 이펙터 단백질 인식[Nat. Commun.]
발표: 김현민 (KAIST)
일자: 2020년 9월 29일 (화) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
성균관대 삼성융합의과학원
박한범 님 전체논문보기 >
관련분야 논문보기



Google (by Hahnbeom Park)
Pubmed (by Hahnbeom Park)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[Webinar] Benchtop type으로 정확하고 경제적인 GenapSys NGS Sequencing System을 소개합니다.
제15회 KSGCT 정기학술대회/온라인
제15회 KSGCT 정기학술대회/온라인
초록접수: ~2020.10.08
사전접수: ~2020.10.23
날짜: 2020.11.05~06
Online 개최
대구경북과학기술원 (DGIST) 뇌·인지과학전공 온라인 전공설명회 개최
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고