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김영광
김영광 (Younggwang Kim) 저자 이메일 보기
연세대학교 의과대학
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  CV updated 2022-06-21 15:15
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SpCas9 activity prediction by DeepSpCas9, a deep learning–based model with high generalization performance
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Abstract

We evaluated SpCas9 activities at 12,832 target sequences using a high-throughput approach based on a human cell library containing single-guide RNA–encoding and target sequence pairs. Deep learning–based training on this large dataset of SpCas9-induced indel frequencies led to the development of a SpCas9 activity–predicting model named DeepSpCas9. When tested against independently generated datasets (our own and those published by other groups), DeepSpCas9 showed high generalization performance. DeepSpCas9 is available at http://deepcrispr.info/DeepSpCas9.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 11월 (BRIC 등록일 2019-11-13)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics
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