[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
사진없음
이태엽 (Taeyeop Lee)
KAIST
조회 404  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Convolutional neural network model to predict causal risk factors that share complex regulatory features
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Major progress in disease genetics has been made through genome-wide association studies (GWASs). One of the key tasks for post-GWAS analyses is to identify causal noncoding variants with regulatory function. Here, on the basis of >2000 functional features, we developed a convolutional neural network framework for combinatorial, nonlinear modeling of complex patterns shared by risk variants scattered among multiple associated loci. When applied for major psychiatric disorders and autoimmune diseases, neural and immune features, respectively, exhibited high explanatory power while reflecting the pathophysiology of the relevant disease. The predicted causal variants were concentrated in active regulatory regions of relevant cell types and tended to be in physical contact with transcription factors while residing in evolutionarily conserved regions and resulting in expression changes of genes related to the given disease. We demonstrate some examples of novel candidate causal variants and associated genes. Our method is expected to contribute to the identification and functional interpretation of potential causal noncoding variants in post-GWAS analyses.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 10월 (BRIC 등록일 2019-10-11)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Genomics
지방대사 불균형에 의한 신경퇴행 기전 연구[Neuron]
정형록
발표: 정형록 (HHMI/Baylor College of M...)
일자: 2020년 7월 8일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
광유전학의 과거, 현재와 미래[Neuron]
김윤석
발표: 김윤석 (Stanford University)
일자: 2020년 7월 30일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
(주)비아이코퍼레이션
관련링크
이태엽 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Genomics

외부링크
Google (by Taeyeop Lee)
Pubmed (by Taeyeop Lee)
제품평가
[비아이코퍼레이션]
e브릭몰(연구용 제품 온라인 구매 사이트)
제품이미지
모집인원: 50명
모집기간: ~7/15
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 3만원 상품권 제공

제품평가자 모집중
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
BRIC X Leica Microsystems와 함께하는 Summer Camp
BRIC X Leica Microsystems와 함께하는 Summer Camp
사전접수: ~2020.07.15
날짜: 2020.07.21~29
장소: 서울 강남구 청담동 53-8 은성빌딩 6층
[BRIC Webinar]Genome Editing and Its Applications[GenScript]
[BRIC Webinar]Genome Editing and Its Applications[GenScript]
사전접수: ~2020.07.13
날짜: 2020.07.14
Online 개최
[고용부 재직자 무료] 『 07.09~07.10 / 분석기기(HPLC) 활용 품질검사 실습 』 『 07.16~07.17 / 화장품 GMP 품질관리 이해 』 『 07.21~07.22 / 비임상시험의 이해 』 충북산학융합본부 7월 재직자 무료과정
[10x Genomics Webinar] Visium Day - 조직의 위치정보를 가진 transcriptome 분석
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해과정(7/8~10)
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해과정(7/8~10)
날짜: 2020.07.08~10
장소: 경기도 안양시 동안구 시민대로 401 대륭테크노타운15차 9층 이레테크 데이터랩스
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 9기 모집
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 9기 모집
날짜: 2020.09.01~06.11
장소: 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크