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김홍숙
김홍숙 (Hong Sook Kim) 저자 이메일 보기
성균관대학교 의과대학, 삼성서울병원
 
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DNA methylation loss promotes immune evasion of tumours with high mutation and copy number load
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Mitotic cell division increases tumour mutation burden and copy number load, predictive markers of the clinical benefit of immunotherapy. Cell division correlates also with genomic demethylation involving methylation loss in late-replicating partial methylation domains. Here we find that immunomodulatory pathway genes are concentrated in these domains and transcriptionally repressed in demethylated tumours with CpG island promoter hypermethylation. Global methylation loss correlated with immune evasion signatures independently of mutation burden and aneuploidy. Methylome data of our cohort (n = 60) and a published cohort (n = 81) in lung cancer and a melanoma cohort (n = 40) consistently demonstrated that genomic methylation alterations counteract the contribution of high mutation burden and increase immunotherapeutic resistance. Higher predictive power was observed for methylation loss than mutation burden. We also found that genomic hypomethylation correlates with the immune escape signatures of aneuploid tumours. Hence, DNA methylation alterations implicate epigenetic modulation in precision immunotherapy.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 09월 (BRIC 등록일 2019-09-20)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Immunology, Genomics, Genetics
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