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이봉진 (Bong Jin Lee) 저자 이메일 보기
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A novel chlorination-induced ribonuclease YabJ from Staphylococcus aureus
열기 Authors and Affiliations


The characteristic fold of a protein is the decisive factor for its biological function. However, small structural changes to amino acids can also affect their function, for example in the case of post-translational modification (PTM). Many different types of PTMs are known, but for some, including chlorination, studies elucidating their importance are limited. A recent study revealed that the YjgF/YER057c/UK114 family (YjgF family) member RidA from Escherichia coli shows chaperone activity after chlorination. Thus, to identify the functional and structural differences of RidA upon chlorination, we studied an RidA homolog from Staphylococcus aureus: YabJ. The overall structure of S. aureus YabJ was similar to other members of the YjgF family, showing deep pockets on its surface, and the residues composing the pockets were well conserved. S. aureus YabJ was highly stable after chlorination, and the chlorinated state is reversible by treatment with DTT. However, it shows no chaperone activity after chlorination. Instead, YabJ from S. aureus shows chlorination-induced ribonuclease activity, and the activity is diminished after subsequent reduction. Even though the yabJ genes from Staphylococcus and Bacillus are clustered with regulators that are expected to code nucleic acid-interacting proteins, the nucleic acid-related activity of bacterial RidA has not been identified before. From our study, we revealed the structure and function of S. aureus YabJ as a novel chlorination-activated ribonuclease. The present study will contribute to an in-depth understanding of chlorination as a PTM.

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 10월 (BRIC 등록일 2019-09-20)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biochemistry, Molecular_Biology, Cell_Biology
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: Collet J and Goemans C: F1000Prime Recommendation of [Kim HJ et al., Biosci Rep 2018 38(5)]. In F1000Prime, 18 Sep 2019; 10.3410/f.734024752.793565266
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다중오믹스 분석을 통한 식물 할로게나제 발견[Nat. Commun.]
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