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황정욱
황정욱 (Jungwook Hwang) 저자 이메일 보기
한양대학교
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UPF1/SMG7-dependent microRNA-mediated gene regulation
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Abstract

The stability and quality of metazoan mRNAs are under microRNA (miRNA)-mediated and nonsense-mediated control. Although UPF1, a core mediator of nonsense-mediated mRNA decay (NMD), mediates the decay of target mRNA in a 3′UTR-length-dependent manner, the detailed mechanism remains unclear. Here, we suggest that 3′UTR-length-dependent mRNA decay is not mediated by nonsense mRNAs but rather by miRNAs that downregulate target mRNAs via Ago-associated UPF1/SMG7. Global analyses of mRNAs in response to UPF1 RNA interference in miRNA-deficient cells reveal that 3′UTR-length-dependent mRNA decay by UPF1 requires canonical miRNA targeting. The destabilization of miRNA targets is accomplished by the combination of Ago2 and UPF1/SMG7, which may recruit the CCR4-NOT deadenylase complex. Indeed, loss of the SMG7-deadenylase complex interaction increases the levels of transcripts regulated by UPF1-SMG7. This UPF1/SMG7-dependent miRNA-mediated mRNA decay pathway may enable miRNA targeting to become more predictable and expand the miRNA-mRNA regulatory network.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 09월 (BRIC 등록일 2019-09-15)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Bioinformatics, Genomics, Genetics
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