[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
제품평가단 모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
LABox-과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 한빛사논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
류국희
류국희 (Kook Hui Ryu) 저자 이메일 보기
University of Michigan
저자CV 보기
96 KB
 
조회 869  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Single-Cell RNA Sequencing Resolves Molecular Relationships Among Individual Plant Cells
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has been used extensively to study cell-specific gene expression in animals, but it has not been widely applied to plants. Here, we describe the use of a commercially available droplet-based microfluidics platform for high-throughput scRNA-seq to obtain single-cell transcriptomes from protoplasts of more than 10,000 Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) root cells. We find that all major tissues and developmental stages are represented in this single-cell transcriptome population. Further, distinct subpopulations and rare cell types, including putative quiescent center cells, were identified. A focused analysis of root epidermal cell transcriptomes defined developmental trajectories for individual cells progressing from meristematic through mature stages of root-hair and nonhair cell differentiation. In addition, single-cell transcriptomes were obtained from root epidermis mutants, enabling a comparative analysis of gene expression at single-cell resolution and providing an unprecedented view of the impact of the mutated genes. Overall, this study demonstrates the feasibility and utility of scRNA-seq in plants and provides a first-generation gene expression map of the Arabidopsis root at single-cell resolution.
 

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 04월 (BRIC 등록일 2019-08-27)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Plant Science, Physiology
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: Schaller G: F1000Prime Recommendation of [Ryu KH et al., Plant Physiol 2019 179(4):1444-1456]. In F1000Prime, 22 Aug 2019; 10.3410/f.735000419.793563862
세포 형광 이미징 멀티플렉싱을 위한 초고속 사이클링[Angew. Chem.-Int. Edit.]
고진아
발표: 고진아 (Massachusetts General Ho...)
일자: 2020년 4월 14일 (화) 오전 10시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기

  댓글 1
회원작성글 Tilldawn  (2019-09-09 23:12)
류박사 축하합니다. plant single cell transcriptomics 배워야 겠네요 ㅎㅎ
등록
 
(주)비아이코퍼레이션
관련링크
류국희 님 전체논문보기 >
관련분야 논문보기
Plant Science

Physiology

외부링크
Google (by Kook Hui Ryu)
Pubmed (by Kook Hui Ryu)
제품평가
[필코리아테크놀로지]
Sapphire Biomolecular Imager
제품이미지
모집인원: 10명
모집기간: ~3/31
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 10만원 상품권 제공
- 우수평가자 5명에게 10만원 상품권 추가 제공

제품평가자 모집중
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[재직자무료교육] 분석기기(HPLC) 활용 품질검사 실습(4.9~4.10) / 화장품 제형제조 기술 실습(4.13~4.14)
[재직자무료교육] 분석기기(HPLC) 활용 품질검사 실습(4.9~4.10) / 화장품 제형제조 기술 실습(4.13~4.14)
날짜: 2020.04.09~14
장소: 충청북도 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명1로 194-41 충북산학융합본부 기업연구1관 교육장
[BRIC Webinar]새로운 염기서열 분석방법(BTSeq)을 이용한 hCoV-19 전장유전체 염기서열의 동정 [CELEMICS]
[BRIC Webinar]Infectious disease 연구에 Chromium single cell solution을 활용한 사례[다온비에스]
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아