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박성열
박성열 (Seongyeol Park) 저자 이메일 보기
KAIST
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Tracing Oncogene Rearrangements in the Mutational History of Lung Adenocarcinoma
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Abstract

Mutational processes giving rise to lung adenocarcinomas (LADCs) in non-smokers remain elusive. We analyzed 138 LADC whole genomes, including 83 cases with minimal contribution of smoking-associated mutational signature. Genomic rearrangements were not correlated with smoking-associated mutations and frequently served as driver events of smoking-signature-low LADCs. Complex genomic rearrangements, including chromothripsis and chromoplexy, generated 74% of known fusion oncogenes, including EML4-ALK, CD74-ROS1, and KIF5B-RET. Unlike other collateral rearrangements, these fusion-oncogene-associated rearrangements were frequently copy-number-balanced, representing a genomic signature of early oncogenesis. Analysis of mutation timing revealed that fusions and point mutations of canonical oncogenes were often acquired in the early decades of life. During a long latency, cancer-related genes were disrupted or amplified by complex rearrangements. The genomic landscape was different between subgroups—EGFR-mutant LADCs had frequent whole-genome duplications with p53 mutations, whereas fusion-oncogene-driven LADCs had frequent SETD2 mutations. Our study highlights LADC oncogenesis driven by endogenous mutational processes.

논문정보
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2019년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 05월 (BRIC 등록일 2019-05-31)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Cell_Biology, Biochemistry, Molecular_Biology
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박성열(KAIST)  |  발표일자: 2019-07-17
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