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옥찬영
옥찬영 (Chan-Young Ock) 저자 이메일 보기
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Pan-Cancer Immunogenomic Perspective on the Tumor Microenvironment Based on PD-L1 and CD8 T-Cell Infiltration
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Purpose: There is currently no reliable biomarker to predict who would benefit from anti-PD-1/PD-L1 inhibitors. We comprehensively analyzed the immunogenomic properties in The Cancer Genome Atlas (TCGA) according to the classification of tumor into four groups based on PD-L1 status and tumor-infiltrating lymphocyte recruitment (TIL), a combination that has been suggested to be a theoretically reliable biomarker of anti-PD-1/PD-L1 inhibitors.

Experimental Design: The RNA expression levels of PD-L1 and CD8A in the samples in the pan-cancer database of TCGA (N = 9,677) were analyzed. Based on their median values, the samples were classified into four tumor microenvironment immune types (TMIT). The mutational profiles, PD-L1 amplification, and viral association of the samples were compared according to the four TMITs.

Results: The proportions of TMIT I, defined by high PD-L1 and CD8A expression, were high in lung adenocarcinoma (67.1%) and kidney clear cell carcinoma (64.8%) among solid cancers. The number of somatic mutations and the proportion of microsatellite instable-high tumor in TMIT I were significantly higher than those in other TMITs, respectively (P < 0.001). PD-L1 amplification and oncogenic virus infection were significantly associated with TMIT I, respectively (P < 0.001). A multivariate analysis confirmed that the number of somatic mutations, PD-L1 amplification, and Epstein–Barr virus/human papillomavirus infection were independently associated with TMIT I.

Conclusions: TMIT I is associated with a high mutational burden, PD-L1 amplification, and oncogenic viral infection. This integrative analysis highlights the importance of the assessment of both PD-L1 expression and TIL recruitment to predict responders to immune checkpoint inhibitors

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2016년 05월 (BRIC 등록일 2019-04-22)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Cancer Biology/Oncology
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
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장철순
발표: 장철순 (Princeton University)
일자: 2020년 6월 3일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
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