[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
이벤트
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
김소정
김소정 (So-Jeong Kim) 저자 이메일 보기
한국지질자원연구원
 
조회 671  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genomic and metatranscriptomic analyses of carbon remineralization in an Antarctic polynya
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Background
Polynyas in the Southern Ocean are regions of intense primary production, mainly by Phaeocystis antarctica. Carbon fixed by phytoplankton in the water column is transferred to higher trophic levels, and finally, to the deep ocean. However, in the Amundsen Sea, most of this organic carbon does not reach the sediment but is degraded in the water column due to high bacterial heterotrophic activity.

Results
We reconstructed 12 key bacterial genomes from different phases of bloom and analyzed the expression of genes involved in organic carbon remineralization. A high correlation of gene expression between the peak and decline phases was observed in an individual genome bin-based pairwise comparison of gene expression. Polaribacter belonging to Bacteroidetes was found to be dominant in the peak phase, and its transcriptional activity was high (48.9% of the total mRNA reads). Two dominant Polaribacter bins had the potential to utilize major polymers in P. antarctica, chrysolaminarin and xylan, with a distinct set of glycosyl hydrolases. In the decline phase, Gammaproteobacteria (Ant4D3, SUP05, and SAR92), with the potential to utilize low molecular weight-dissolved organic matter (LMW-DOM) including compatible solutes, was increased. The versatility of Gammaproteobacteria may contribute to their abundance in organic carbon-rich polynya waters, while the SAR11 clade was found to be predominant in the sea ice-covered oligotrophic ocean. SAR92 clade showed transcriptional activity for utilization of both polysaccharides and LMW-DOM; this may account for their abundance both in the peak and decline phases. Ant4D3 clade was dominant in all phases of the polynya bloom, implicating the crucial roles of this clade in LMW-DOM remineralization in the Antarctic polynyas.

Conclusions
Genomic reconstruction and in situ gene expression analyses revealed the unique metabolic potential of dominant bacteria of the Antarctic polynya at a finer taxonomic level. The information can be used to predict temporal community succession linked to the availability of substrates derived from the P. antarctica bloom. Global warming has resulted in compositional changes in phytoplankton from P. antarctica to diatoms, and thus, repeated parallel studies in various polynyas are required to predict global warming-related changes in carbon remineralization.

Keywords: Carbon remineralization, Genomics, Metatranscriptomics, Polynya

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 02월 (BRIC 등록일 2019-03-08)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Microbiology
  댓글 0
등록
 
목록
GE Healthcare Life Sciences
관련링크
김소정 님 전체논문보기 >
관련인물
김종걸 (충북대학교)
이성근 (충북대학교)
관련분야 논문보기
Microbiology

외부링크
Google (by So-Jeong Kim)
Pubmed (by So-Jeong Kim)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
BRIC X ThermoFisher Scientific과 함께하는 사이언스 바캉스
BRIC X ThermoFisher Scientific과 함께하는 사이언스 바캉스
사전접수: ~2019.07.26
날짜: 2019.08.07~08
장소: 강남구 광평로 281, 수서오피스빌딩 11층 (수서역 3번 출구)
2019 부산대학교 의학전문대학원 의과학과 Open Lab
2019 부산대학교 의학전문대학원 의과학과 Open Lab
사전접수: ~2019.08.20
날짜: 2019.08.29
장소: 부산대학교 의학전문대학원(양산캠퍼스) 통합행정동 116호
[대졸자 대상]바이오QC 실무과정 7기 모집
[대졸자 대상]바이오QC 실무과정 7기 모집
날짜: 2019.09.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
(고용부 재직자 무료과정)바이오/의약분야 계약 및 협상의 이해과정
(고용부 재직자 무료과정)바이오/의약분야 계약 및 협상의 이해과정
날짜: 2019.07.24~26
장소: 경기도 성남시 분당구 판교로289번길 20 스타트업캠퍼스 2층 세미나실
생물정보 빅데이터 분석 UCC 공모전
생물정보 빅데이터 분석 UCC 공모전
날짜: 2019.08.22
주관: K-Genome 유전체빅데..
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS