[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
올림푸스한국
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
김상우
김상우 (Sangwoo Kim) 저자 이메일 보기
연세대학교 의과대학
저자CV 보기
415 KB
  CV updated 2020-07-20 11:29
 
조회 1940  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
The use of technical replication for detection of low-level somatic mutations in next-generation sequencing
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Accurate genome-wide detection of somatic mutations with low variant allele frequency (VAF, <1%) has proven difficult, for which generalized, scalable methods are lacking. Herein, we describe a new computational method, called RePlow, that we developed to detect low-VAF somatic mutations based on simple, library-level replicates for next-generation sequencing on any platform. Through joint analysis of replicates, RePlow is able to remove prevailing background errors in next-generation sequencing analysis, facilitating remarkable improvement in the detection accuracy for low-VAF somatic mutations (up to ~99% reduction in false positives). The method is validated in independent cancer panel and brain tissue sequencing data. Our study suggests a new paradigm with which to exploit an overwhelming abundance of sequencing data for accurate variant detection.
 

논문정보
TOP5
2019년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 03월 (BRIC 등록일 2019-03-05)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Bioinformatics, Genomics
관련 보도자료
1% 미세돌연변이까지 찾아내는 유전자 분석기술 개발
국내 연구진이 그 동안 검출이 어려웠던 미세단위 돌연변이까지 찾아내는 유전자 분석방법 '리플로우(RePlow)'를 개발하여, 국내 정밀의료 분야에 청신호가 켜졌다.
감각을 통증으로 바꾸고 만성화시키는 뇌의 항상성 오작동 [Curr. Biol.]
정지훈
발표: 정지훈 (경희대학교 한의과대학)
일자: 2021년 3월 10일 (수) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
심경색에 따른 심장의 영양소 이용 변화의 정량분석 [Science]
장철순
발표: 장철순 (University of California...)
일자: 2021년 3월 12일 (금) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
PRR11의 PI3K경로 활성화를 통한 항에스트로겐 내성 부여 기전 규명 [Nat. Commun.]
이경민
발표: 이경민 (University of Texas Sout...)
일자: 2021년 3월 17일 (수) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
차세대 디지털 정보 저장 장치로써의 DNA와 효소를 이용한 염기서열의 광학적 병렬 합성법 [Nat. Commun.]
이호원
발표: 이호원 (Wyss Institute for Biolo...)
일자: 2021년 3월 18일 (목) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
수리 모델을 이용한 불안정한 수면 사이클 원인 규명 [Proc. Natl. Acad. Sci. USA]
김대욱
발표: 김대욱 (KAIST)
일자: 2021년 3월 22일 (월) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
관련링크
김상우 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Bioinformatics

Genomics

외부링크
Google (by Sangwoo Kim)
Pubmed (by Sangwoo Kim)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[nanoString Webinar] 대용량 유전자 발현 정량시스템을 이용한 miRNA assay, nCounter System 소개
대구경북과학기술원(DGIST) 뇌·인지과학전공 온라인 전공설명회 개최
대구경북과학기술원(DGIST) 뇌·인지과학전공 온라인 전공설명회 개최
날짜: 2021.03.05
장소: 온라인 링크를 통한 접속
★전액무료★ 바이오분야 재직자 직무능력 향상교육 [3월] 개강 과정 교육생 모집
★전액무료★ 바이오분야 재직자 직무능력 향상교육 [3월] 개강 과정 교육생 모집
날짜: 2021.03.01~31
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송생명1로 194-41
2021 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
2021 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
날짜: 2021.03.31
주관: 서경배과학재단
2021 써모피셔 사이언티픽 UCC 콘테스트
2021 써모피셔 사이언티픽 UCC 콘테스트
날짜: 2021.02.28
주관: 써모피셔 사이언티픽 코리아..
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고