[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
머크
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
염희란
염희란 (Huiran Yeom) 저자 이메일 보기
서울대학교
저자CV 보기
74 KB
  CV updated 2019-03-06 16:57
 
조회 2453  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Barcode-free next-generation sequencing error validation for ultra-rare variant detection
열기 Authors and Affiliations

Abstract

The advent of next-generation sequencing (NGS) has accelerated biomedical research by enabling the high-throughput analysis of DNA sequences at a very low cost. However, NGS has limitations in detecting rare-frequency variants (< 1%) because of high sequencing errors (> 0.1~1%). NGS errors could be filtered out using molecular barcodes, by comparing read replicates among those with the same barcodes. Accordingly, these barcoding methods require redundant reads of non-target sequences, resulting in high sequencing cost. Here, we present a cost-effective NGS error validation method in a barcode-free manner. By physically extracting and individually amplifying the DNA clones of erroneous reads, we distinguish true variants of frequency > 0.003% from the systematic NGS error and selectively validate NGS error after NGS. We achieve a PCR-induced error rate of 2.5×10−6 per base per doubling event, using 10 times less sequencing reads compared to those from previous studies.



논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 02월 (BRIC 등록일 2019-03-05)
- 연구진: 국내연구진태극기
관련 보도자료
정확한 DNA 변이 분석 위한 염기서열 분석 오류 검증 기술 개발
암을 조기에 진단할 수 있도록 암세포 DNA 변이의 정확한 분석을 돕는 검증기술이 국내 연구진에 의해 개발됐다. 울대 공대(학장 차국헌)는 전기정보공학부 권성훈 교수팀이 암 조기 진단을 위한 매우 낮은 비율의 암세포...
편도체로 다중감각 위협 정보를 전달하는 중앙경보시스템에 대한 연구 [Cell Reports]
강석재
발표: 강석재 (Salk Institute for Biolo...)
일자: 2022년 12월 14일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
그래프 딥러닝을 활용한 암 병리 이미지 분석을 통한 암 환자 생존률 예측 및 암 미세환경 마커 발굴[Nat. Biomed. Eng.]
이용주
발표: 이용주 (서울대학교)
일자: 2022년 12월 15일 (목) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
인슐린 수용체-압타머 결합 구조를 통해 밝혀진 인슐린 수용체의 선택적 활성화 기작 [Nat. Commun.]
윤나오
발표: 윤나오 (POSTECH)
일자: 2022년 12월 19일 (월) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
TET 단백질에 의한 지방세포 열생산 조절기전 연구 [Proc. Natl. Acad. Sci. USA.]
변성준
발표: 변성준 (울산과학기술원)
일자: 2022년 12월 22일 (목) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
필수 아미노산 트레오닌의 식이제한 모사 건강 장수 효능 기전 [Nat. Commun.]
김주원
발표: 김주원 (아모레퍼시픽기술연구원)
일자: 2022년 12월 27일 (화) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
Mitoguardin-2를 매개로하는 소포체-미토콘드리아 막접촉점 사이에서의 인지질 수송 [Nat. Commun.]
김현우
발표: 김현우 (UNIST)
일자: 2022년 12월 27일 (화) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
리보솜 구조의 변형을 통한 Co-translational protein folding (번역과 동시에 일어나는 단백질 접힘)의 조절[Nat. Commun.]
안민구
발표: 안민구 (University College Londo...)
일자: 2023년 1월 4일 (수) 오후 03시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기
비만과 염증의 대한 히알루론-담즙 나노 입자의 효능 [ACS Nano]
이왕희
발표: 이왕희 (아주대학교 분자과학기술학과)
일자: 2023년 1월 5일 (목) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
코로나 바이러스 단백질과 인간 단백질 간의 상호작용 지도 [Nat. Biotechnol.]
김대겸
발표: 김대겸 (Roswell Park Comprehensi...)
일자: 2023년 1월 10일 (화) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
관련링크
염희란 님 전체논문보기 >
관련인물
외부링크
ORCID ORCID 0000-0001-8836-2249
Google Scholar
PubMed
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
바이오 연구실습 아카데미 수강생 모집
바이오 연구실습 아카데미 수강생 모집
날짜: 2023.01.02~02.23
장소: 성동구 상원12길 34, 서울숲에이원센터 6층 606호 아이리스랩
[싸이티바 웨비나] 공정 개발을 위한 자동화 올리고뉴클레오타이드 합성 전략
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
사전접수: ~2022.11.15
날짜: 2022.11.16~17
장소: 그래비티 호텔 판교 B1 스페이스 볼룸
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
필코리아테크놀로지 광고