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Ke Luo
Ke Luo (Ke Luo)
경희대학교
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Alpha-Hederin Nanopore for Single Nucleotide Discrimination
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Abstract

Various types of biological and synthetic nanopores have been developed and utilized for the high-throughput investigation of individual biomolecules. Biological nanopores made with channel proteins are so far superior to solid-state ones in terms of sensitivity and reproducibility. However, the performance of a biological nanopore is dependent on the protein in the channel structure its dimensions are predetermined and are difficult to modify for broader applications. Here inspired by the cytotoxic mechanisms of a saponin derivative, alpha-hederin, we report a nonproteinaceous nanopore that can be formed spontaneously in a lipid membrane. We propose the pore-forming mechanism of alpha-hederin in a cholesterol-rich lipid membrane and a strategy to control the pore-forming rate by a lipid partitioning method. The small diameter and effective thickness of alpha-hederin nanopores enabled us to discriminate ssDNA homopolymers as well as four types of nucleotides, showing its potential as a DNA sequencing tool.

Keywords: alpha-hederin; discrimination; nanopore; self-assembly; single nucleotide; size-tunable

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 01월 (BRIC 등록일 2019-01-29)
- 연구진: 국내연구진태극기
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