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김현우 (Hyunwoo Kim) 저자 이메일 보기
한양대학교, 한국과학기술정보연구원
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Proteogenomic Characterization of Human Early-Onset Gastric Cancer
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Abstract

We report proteogenomic analysis of diffuse gastric cancers (GCs) in young populations. Phosphoproteome data elucidated signaling pathways associated with somatic mutations based on mutation-phosphorylation correlations. Moreover, correlations between mRNA and protein abundances provided potential oncogenes and tumor suppressors associated with patient survival. Furthermore, integrated clustering of mRNA, protein, phosphorylation, and N-glycosylation data identified four subtypes of diffuse GCs. Distinguishing these subtypes was possible by proteomic data. Four subtypes were associated with proliferation, immune response, metabolism, and invasion, respectively; and associations of the subtypes with immune- and invasion-related pathways were identified mainly by phosphorylation and N-glycosylation data. Therefore, our proteogenomic analysis provides additional information beyond genomic analyses, which can improve understanding of cancer biology and patient stratification in diffuse GCs.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 01월 (BRIC 등록일 2019-01-15)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
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