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김상옥 (Sangok Kim) 저자 이메일 보기
이화여자대학교
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Proteogenomic Characterization of Human Early-Onset Gastric Cancer
열기 Authors and Affiliations

Abstract

We report proteogenomic analysis of diffuse gastric cancers (GCs) in young populations. Phosphoproteome data elucidated signaling pathways associated with somatic mutations based on mutation-phosphorylation correlations. Moreover, correlations between mRNA and protein abundances provided potential oncogenes and tumor suppressors associated with patient survival. Furthermore, integrated clustering of mRNA, protein, phosphorylation, and N-glycosylation data identified four subtypes of diffuse GCs. Distinguishing these subtypes was possible by proteomic data. Four subtypes were associated with proliferation, immune response, metabolism, and invasion, respectively; and associations of the subtypes with immune- and invasion-related pathways were identified mainly by phosphorylation and N-glycosylation data. Therefore, our proteogenomic analysis provides additional information beyond genomic analyses, which can improve understanding of cancer biology and patient stratification in diffuse GCs.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 01월 (BRIC 등록일 2019-01-15)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
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