[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
랩박스 - 형광 이미징의 모든 것
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
최정균
최정균 (Jung Kyoon Choi) 저자 이메일 보기
KAIST
저자CV 보기
73 KB
 
조회 631  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Immune signatures correlate with L1 retrotransposition in gastrointestinal cancers
열기 Authors and Affiliations

Abstract
Long interspersed nuclear element-1 (LINE-1 or L1) retrotransposons are normally suppressed in somatic tissues mainly due to DNA methylation and antiviral defense. However, the mechanism to suppress L1s may be disrupted in cancers, thus allowing L1s to act as insertional mutagens and cause genomic rearrangement and instability. Whereas the frequency of somatic L1 insertions varies greatly among individual tumors, much remains to be learned about underlying genetic, cellular, or environmental factors. Here, we report multiple correlates of L1 activity in stomach, colorectal, and esophageal tumors through an integrative analysis of cancer whole genome and matched RNA sequencing profiles. Clinical indicators of tumor progression, such as tumor grade and patient age, showed positive association. A potential L1 expression suppressor, TP53, was mutated in tumors with frequent L1 insertions. We characterized the effects of somatic L1 insertions on mRNA splicing and expression, and demonstrated an increased risk of gene disruption in retrotransposition-prone cancers. In particular, we found that a cancer-specific L1 insertion in an exon of MOV10, a key L1 suppressor, caused exon skipping and decreased expression of the affected allele due to nonsense-mediated decay in a tumor with a high L1 insertion load. Importantly, tumors with high immune activity, for example, those associated with Epstein-Barr virus infection or microsatellite instability, tended to carry a low number of L1 insertions in genomes with high expression levels of L1 suppressors such as APOBEC3s and SAMHD1. Our results indicate that cancer immunity may contribute to genome stability by suppressing L1 retrotransposition in gastrointestinal cancers.

Keywords: LINE-1 retrotransposition, cancer immunity, gastrointestinal cancer
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 07월 (BRIC 등록일 2018-07-06)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Genetics, Biotechnology, Molecular_Biology
과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
장철순
발표: 장철순 (Princeton University)
일자: 2020년 6월 3일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
접수가 마감되었습니다.

  댓글 0
등록
 
목록
밀테니바이오텍 코리아
관련링크
최정균 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Genetics

Biotechnology

Biochemistry

외부링크
Google (by Jung Kyoon Choi)
Pubmed (by Jung Kyoon Choi)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
Azure Cielo real-time PCR system 런칭 기념 본사 Webinar
SYNTHEGO CRISPR Genom Editing Virtual Seminar
SYNTHEGO CRISPR Genom Editing Virtual Seminar
날짜: 2020.06.17
Online 개최
[BRIC Webinar]코로나바이러스 감염 특성과 코로나바이러스감염증-19의 병인 기전 연구[대한바이러스학회]
[BRIC Webinar]과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
[BRIC Webinar]과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
사전접수: ~2020.06.02
날짜: 2020.06.03
Online 개최
[오송첨단의료산업진흥재단] 바이오의약품 전문인력 양성교육 2차 교육생 모집
[오송첨단의료산업진흥재단] 바이오의약품 전문인력 양성교육 2차 교육생 모집
사전접수: ~2020.06.12
날짜: 2020.06.22~08.21
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명로 123 오송첨단의료산업진흥재단
[재직자 무료교육] 충북산학융합본부 5월 교육과정 (분석기기 실습, 의약품 GMP 기본)
[재직자 무료교육] 충북산학융합본부 5월 교육과정 (분석기기 실습, 의약품 GMP 기본)
날짜: 2020.05.25~06.05
장소: 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명1로 194-41 충북산학융합본부
2020 제약바이오 분자진단 전문인력 양성과정  공고
2020 제약바이오 분자진단 전문인력 양성과정 공고
사전접수: ~2020.06.14
날짜: 2020.07.08~08.28
장소: 서울과학기술여성새로일하기센터 (강남역 12번 출구) 및 전문기관 교육장
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해 과정
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해 과정
날짜: 2020.05.27~29
장소: 경기도 성남시 분당구 판교로289번길 20 스타트업캠퍼스 2층 세미나실1
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아