[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
라이카써머캠프
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
한재용
한재용 (Jae Yong Han) 저자 이메일 보기
서울대학교, Shinshu University
저자CV 보기
619 KB
 
조회 765  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
The first whole transcriptomic exploration of pre-oviposited early chicken embryos using single and bulked embryonic RNA-sequencing
열기 Authors and Affiliations

Abstract
Background
The chicken is a valuable model organism, especially in evolutionary and embryology research because its embryonic development occurs in the egg. However, despite its scientific importance, no transcriptome data have been generated for deciphering the early developmental stages of the chicken because of practical and technical constraints accessing pre-oviposited embryos.

Findings
Here, we determine the entire transcriptome of pre-oviposited avian embryos, including oocyte, zygote, and intrauterine embryos from Eyal-giladi and Kochav stage I (EGK.I) to EGK.X collected using a non-invasive approach for the first time. We also compare RNA-sequencing data obtained using bulked embryo sequencing and single embryo/cell sequencing technique. The raw sequencing data were pre-processed with two different genome builds, Galgal4 and Galgal5, and the expression of 17,108 and 26,102 genes was quantified in the respective builds. There were some differences between the two techniques, as well as between the two genome builds, and these were affected by the emergence of long intergenic non-coding RNA annotations.

Conclusion
The first transcriptome datasets of pre-oviposited early chicken embryos based on bulked and single embryo sequencing techniques will serve as a valuable resource for investigating early avian embryogenesis, for comparative studies among vertebrates, and for novel gene annotation in the chicken genome.

Keywords : RNA-seq - Single embryonic sequencing - Single cell sequencing - Early embryo - Chicken
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 03월 (BRIC 등록일 2018-03-28)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Developmental_Biology, Bioinformatics, Biotechnology
광유전학의 과거, 현재와 미래[Neuron]
김윤석
발표: 김윤석 (Stanford University)
일자: 2020년 7월 30일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
울산대학교 의과대학
관련링크
한재용 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Developmental_Biology

Bioinformatics

Biochemistry

외부링크
Google (by Jae Yong Han)
Pubmed (by Jae Yong Han)
제품평가
[비아이코퍼레이션]
e브릭몰(연구용 제품 온라인 구매 사이트)
제품이미지
모집인원: 50명
모집기간: ~7/15
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 3만원 상품권 제공

제품평가자 모집중
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]3차원 이미징의 최적 솔루션, THUNDER Computational Clearing 기술 소개[Leica Microsystems]
[BRIC Webinar]연구 속도를 높일 수 있는 공초점 플랫폼 STELLARIS 기술 소개[Leica Microsystems]
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크