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주철민
주철민 (Chirlmin Joo) 저자 이메일 보기
Delft University of Technology
 
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Single-molecule peptide fingerprinting
열기 Authors and Affiliations

Abstract
Proteomic analyses provide essential information on molecular pathways of cellular systems and the state of a living organism. Mass spectrometry is currently the first choice for proteomic analysis. However, the requirement for a large amount of sample renders a small-scale proteomics study challenging. Here, we demonstrate a proof of concept of single-molecule FRET-based protein fingerprinting. We harnessed the AAA+ protease ClpXP to scan peptides. By using donor fluorophore-labeled ClpP, we sequentially read out FRET signals from acceptor-labeled amino acids of peptides. The repurposed ClpXP exhibits unidirectional processing with high processivity and has the potential to detect low-abundance proteins. Our technique is a promising approach for sequencing protein substrates using a small amount of sample.

single-molecule FRET, ClpXP, protein analysis, peptides, single-molecule protein sequencing
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 03월 (BRIC 등록일 2018-03-13)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Biophysics, Biotechnology, Proteomics
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