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김희권
김희권 (Hui Kwon Kim) 저자 이메일 보기
연세대학교 의과대학
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331 KB
  CV updated 2020-09-22 14:46
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조회 2847  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Deep learning improves prediction of CRISPR–Cpf1 guide RNA activity
열기 Authors and Affiliations

Abstract

We present two algorithms to predict the activity of AsCpf1 guide RNAs. Indel frequencies for 15,000 target sequences were used in a deep-learning framework based on a convolutional neural network to train Seq-deepCpf1. We then incorporated chromatin accessibility information to create the better-performing DeepCpf1 algorithm for cell lines for which such information is available and show that both algorithms outperform previous machine learning algorithms on our own and published data sets.

논문정보
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2018년 선정
| F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 01월 (BRIC 등록일 2018-01-30)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biotechnology
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