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홍성철
홍성철 (Sungchul Hohng) 저자 이메일 보기
서울대학교
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Single-molecule FRET studies on the cotranscriptional folding of a thiamine pyrophosphate riboswitch
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Abstract
Because RNAs fold as they are being synthesized, their transcription rate can affect their folding. Here, we report the results of single-molecule fluorescence studies that characterize the ligand-dependent cotranscriptional folding of the Escherichia coli thiM riboswitch that regulates translation. We found that the riboswitch aptamer folds into the “off” conformation independent of its ligand, but switches to the “on” conformation during transcriptional pausing near the translational start codon. Ligand binding maintains the riboswitch in the off conformation during transcriptional pauses. We expect our assay will permit the controlled study of the two main physical mechanisms that regulate cotranscriptional folding: transcriptional pausing and transcriptional speed.

thiamine pyrophosphate riboswitch, single-molecule FRET, cotranscriptional folding
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 12월 (BRIC 등록일 2017-12-27)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biophysics
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김현민
발표: 김현민 (KAIST)
일자: 2020년 9월 29일 (화) 오후 02시 (한국시간)
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