[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
실험복 제공
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2
전체보기 한빛사논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
염선인
염선인 (Seon-In Yeom) 저자 이메일 보기
경상대학교
 
조회 1653  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genome analysis of Hibiscus syriacus provides insights of polyploidization and indeterminate flowering in woody plants
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Hibiscus syriacus (L.) (rose of Sharon) is one of the most widespread garden shrubs in the world. We report a draft of the H. syriacus genome comprised of a 1.75?Gb assembly that covers 92% of the genome with only 1.7% (33?Mb) gap sequences. Predicted gene modeling detected 87,603 genes, mostly supported by deep RNA sequencing data. To define gene family distribution among relatives of H. syriacus, orthologous gene sets containing 164,660 genes in 21,472 clusters were identified by OrthoMCL analysis of five plant species, including H. syriacus, Arabidopsis thaliana, Gossypium raimondii, Theobroma cacao and Amborella trichopoda. We inferred their evolutionary relationships based on divergence times among Malvaceae plant genes and found that gene families involved in flowering regulation and disease resistance were more highly divergent and expanded in H. syriacus than in its close relatives, G. raimondii (DD) and T. cacao. Clustered gene families and gene collinearity analysis revealed that two recent rounds of whole-genome duplication were followed by diploidization of the H. syriacus genome after speciation. Copy number variation and phylogenetic divergence indicates that WGDs and subsequent diploidization led to unequal duplication and deletion of flowering-related genes in H. syriacus and may affect its unique floral morphology.

Hibiscus syriacus, Whole Genome Duplication, Diploidization, Multivoltinism, Homeolog

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 02월 (BRIC 등록일 2017-08-29)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: F1000Prime Recommendations, Dissents and Comments for [Kim YM et al., DNA Res 2017, 24(1):71-80]. In F1000Prime, 29 Aug 2017; F1000Prime.com/727178795
달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
이대한
발표: 이대한 (Northwestern University)
일자: 2019년 12월 12일 (목) 오후 01시 (한국시간)
언어:
참석자 접수신청하기
수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
최경환
발표: 최경환 (University of Chicago)
일자: 2019년 12월 19일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
오송첨단의료산업진흥재단
관련링크
염선인 님 전체논문보기 >
관련인물
구남진 (한국생명공학연구원)
김승일 (서울대학교)
김용민 (한국생명공학연구원)
김운봉 (한국생명공학연구원)
박민규 (서울대학교)
서은영 (UC Berkeley)
신아영 (한국생명공학연구원)
이제민 (서울대학교)
이현아 (서울대학교)
최도일 (서울대학교)
관련분야 논문보기
Genetics

외부링크
Google (by Seon-In Yeom)
Pubmed (by Seon-In Yeom)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
[BRIC Webinar]수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
사전접수: ~2019.12.18
날짜: 2019.12.19
Online 개최
의약품 GMP 품질관리 실무
의약품 GMP 품질관리 실무
사전접수: ~2019.12.13
날짜: 2019.12.12~13
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명 1로 194-41 기업연구관 1관 충북산학융합본부 1층 강의실
[BRIC Webinar] 달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
[BRIC Webinar] 달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
사전접수: ~2019.12.11
날짜: 2019.12.12
Online 개최
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
사전접수: ~2020.01.06
날짜: 2020.03.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크