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김승수
김승수 (Seungsoo Kim) 저자 이메일 보기
University of Washington
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  CV updated 2019-09-17 01:58
 
조회 2639  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
The dynamic three-dimensional organization of the diploid yeast genome
열기 Authors and Affiliations

Abstract
The budding yeast Saccharomyces cerevisiae is a long-standing model for the three-dimensional organization of eukaryotic genomes. However, even in this well-studied model, it is unclear how homolog pairing in diploids or environmental conditions influence overall genome organization. Here, we performed high-throughput chromosome conformation capture on diverged Saccharomyces hybrid diploids to obtain the first global view of chromosome conformation in diploid yeasts. After controlling for the Rabl-like orientation using a polymer model, we observe significant homolog proximity that increases in saturated culture conditions. Surprisingly, we observe a localized increase in homologous interactions between the HAS1-TDA1 alleles specifically under galactose induction and saturated growth. This pairing is accompanied by relocalization to the nuclear periphery and requires Nup2, suggesting a role for nuclear pore complexes. Together, these results reveal that the diploid yeast genome has a dynamic and complex 3D organization.
논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 06월 (BRIC 등록일 2017-06-30)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Genetics, Genomics, Evolution
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: F1000Prime Recommendations, Dissents and Comments for [Kim S et al., elife 2017, 6]. In F1000Prime, 03 Jul 2017; F1000Prime.com/727648048
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