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한원식
한원식 (Wonshik Han) 저자 이메일 보기
서울대학교 의과대학
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Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer
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Abstract

Single-cell transcriptome profiling of tumour tissue isolates allows the characterization of heterogeneous tumour cells along with neighbouring stromal and immune cells. Here we adopt this powerful approach to breast cancer and analyse 515 cells from 11 patients. Inferred copy number variations from the single-cell RNA-seq data separate carcinoma cells from non-cancer cells. At a single-cell resolution, carcinoma cells display common signatures within the tumour as well as intratumoral heterogeneity regarding breast cancer subtype and crucial cancer-related pathways. Most of the non-cancer cells are immune cells, with three distinct clusters of T lymphocytes, B lymphocytes and macrophages. T lymphocytes and macrophages both display immunosuppressive characteristics: T cells with a regulatory or an exhausted phenotype and macrophages with an M2 phenotype. These results illustrate that the breast cancer transcriptome has a wide range of intratumoral heterogeneity, which is shaped by the tumour cells and immune cells in the surrounding microenvironment.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 05월 (BRIC 등록일 2020-03-12)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Genomics, Cancer Biology/Oncology, Immunology
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
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