[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
2019 Bio Top5 인터뷰
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
정교원
정교원 (Kyowon Jeong) 저자 이메일 보기
서울대학교, 기초과학연구원
 
조회 1123  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genome-wide Mapping of DROSHA Cleavage Sites on Primary MicroRNAs and Noncanonical Substrates
열기 Authors and Affiliations

Abstract
MicroRNA (miRNA) maturation is initiated by DROSHA, a double-stranded RNA (dsRNA)-specific RNase III enzyme. By cleaving primary miRNAs (pri-miRNAs) at specific positions, DROSHA serves as a main determinant of miRNA sequences and a highly selective gatekeeper for the canonical miRNA pathway. However, the sites of DROSHA-mediated processing have not been annotated, and it remains unclear to what extent DROSHA functions outside the miRNA pathway. Here, we establish a protocol termed “formaldehyde crosslinking, immunoprecipitation, and sequencing (fCLIP-seq),” which allows identification of DROSHA cleavage sites at single-nucleotide resolution. fCLIP identifies numerous processing sites, suggesting widespread end modifications during miRNA maturation. fCLIP also finds many pri-miRNAs that undergo alternative processing, yielding multiple miRNA isoforms. Moreover, we discovered dozens of DROSHA substrates on non-miRNA loci, which may serve as cis-elements for DROSHA-mediated gene regulation. We anticipate that fCLIP-seq could be a general tool for investigating interactions between dsRNA-binding proteins and structured RNAs.

Keywords:
DROSHA, DGCR8, microprocessor, microRNA, pri-miRNA, formaldehyde crosslinking, RNA, sequencing, CLIP-seq
논문정보
TOP5
2017년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 04월 (BRIC 등록일 2017-04-21)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Cell_Biology, Biochemistry, Molecular_Biology
관련 보도자료
인간 세포에서 정확한 마이크로RNA 정보 읽어
인간 세포에서 정확한 마이크로RNA 정보 읽어    Bio통신원  |  2017.04.21
기초과학연구원(IBS) RNA 연구단 김빛내리 단장 연구팀은 마이크로RNA가 드로셔(DROSHA) 단백질에 의해 형성되는 과정을 인체 세포 내에서 확인하는 데 성공했다. 연구팀은 드로셔 단백질이 마이크로RNA를 자르...
경제적 의사결정의 개별과정을 동질한 성격의 뉴런으로 구현하기[Neuron]
유승범
발표: 유승범 (University of Minnesota)
일자: 2020년 1월 29일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기
유전자 편집 기술을 활용한 도시농업 적합 작물 개발[Nat. Biotechnol.]
권춘탁
발표: 권춘탁 (Cold Spring Harbor Labor...)
일자: 2020년 2월 19일 (수) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
데일리파트너스
관련링크
정교원 님 전체논문보기 >
관련인물
김백규 (서울대학교, 기초과학연구원)
김빛내리 (서울대학교)
김상우 (연세대학교 의과대학)
관련분야 논문보기
Cell_Biology

Biochemistry

Biochemistry

외부링크
Google (by Kyowon Jeong)
Pubmed (by Kyowon Jeong)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]경제적 의사결정의 개별과정을 동질한 성격의 뉴런으로 구현하기[Neuron]
[BRIC Webinar]Overview of NGS library Preparation[필코리아테크놀로지]
[BRIC Webinar]Overview of NGS library Preparation[필코리아테크놀로지]
사전접수: ~2020.01.21
날짜: 2020.01.22
Online 개최
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
사전접수: ~2020.02.10
날짜: 2020.03.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
라이카코리아