[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
실험복 제공
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
최길주
최길주 (Giltsu Choi) 저자 이메일 보기
KAIST
 
조회 1155  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
PIF1-interacting transcription factors and their binding sequence elements determine the in vivo targeting sites of PIF1

Junghyun Kima,1, Hyojin Kangb,1, Jeongmoo Parka,1, Woohyun Kima, Janghyun Yooc , Nayoung Leea, Jaewook Kima, Tae-young Yoonc, and Giltsu Choia,2

a Department of Biological Sciences, KAIST, Daejeon 34141, Korea
b Department of Convergence Technology Research, KISTI, Daejeon 34141, Korea
c Department of Physics, KAIST, Daejeon 34141, Korea

1 Contributed equally
2 Corresponding Author

Abstract
The bHLH transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 1 (PIF1) binds G box elements in vitro and inhibits light-dependent germination in Arabidopsis thaliana. A previous genome-wide analysis of PIF1 targeting indicated that PIF1 binds 748 sites in imbibed seeds, only 59% of which possess G-box elements. This suggests the G-box is not the sole determinant of PIF1 targeting. The targeting of PIF1 to specific sites could be stabilized by PIF1-interacting transcription factors (PTFs) that bind other nearby sequence elements. Here, we report PIF1 targeting sites are enriched with not only G-boxes but also with other hexameric sequence elements we named G-box coupling elements (GCEs). One of these GCEs possesses an ACGT core and serves as a binding site for group A bZIP transcription factors including ABSCISIC ACID INSENSITIVE 5 (ABI5), which inhibits seed germination in abscisic acid signaling. PIF1 interacts with ABI5 and other group A bZIP transcription factors and together they target a subset of PIF1 binding sites in vivo. In vitro single molecule fluorescence imaging confirms that ABI5 facilitates PIF1 binding to DNA fragments possessing multiple G-boxes or the GCE alone. Thus, we show in vivo PIF1 targeting to specific binding sites is determined by its interaction with PTFs and their binding to GCEs.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2016년 06월 (BRIC 등록일 2016-06-16)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Plant Science
달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
이대한
발표: 이대한 (Northwestern University)
일자: 2019년 12월 12일 (목) 오후 01시 (한국시간)
언어:
참석자 접수신청하기
수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
최경환
발표: 최경환 (University of Chicago)
일자: 2019년 12월 19일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
라이카코리아
관련링크
최길주 님 전체논문보기 >
관련인물
Khoa Thi Nguyen (KAI...)
Yasuhito Sakuraba (서...)
강효진 (한국과학기술정보연구원)
김근화 (KAIST)
김동환 (University of T...)
김여재 (KAIST)
김재욱 (KAIST)
김정현 (KAIST)
김종현 (KAIST)
박은애 (KAIST)
박정무 (Duke University...)
배갑용 (KAIST)
백남천 (서울대학교)
백인엽 (University of T...)
송기종 (KAIST)
송필순 (제주대학교)
신병철 (GIST, 금호생명환경과학연...)
신지은 (Max Planck Inst...)
오은규 (고려대학교)
이나영 (KAIST)
임수환 (KAIST)
정진길 (KAIST)
관련분야 논문보기
Plant Science

외부링크
Google (by Giltsu Choi)
Pubmed (by Giltsu Choi)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
[BRIC Webinar]수학울렁증에 대한 인지신경과학적 접근[Sci. Adv.]
사전접수: ~2019.12.18
날짜: 2019.12.19
Online 개최
의약품 GMP 품질관리 실무
의약품 GMP 품질관리 실무
사전접수: ~2019.12.13
날짜: 2019.12.12~13
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명 1로 194-41 기업연구관 1관 충북산학융합본부 1층 강의실
[BRIC Webinar] 달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
[BRIC Webinar] 달콤한 대화의 진화 [Nat. Ecol. Evol.]
사전접수: ~2019.12.11
날짜: 2019.12.12
Online 개최
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
[무료/취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
사전접수: ~2020.01.06
날짜: 2020.03.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크