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김희남
김희남 (Heenam Stanley Kim) 저자 이메일 보기
고려대학교
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  CV updated 2018-07-24 17:10
 
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Faecalibacterium prausnitzii subspecies–level dysbiosis in the human gut microbiome underlying atopic dermatitis
열기 Authors and Affiliations

Abstract
Han Song, PhDa, *, Young Yoo, MD, PhDb, *, Junghyun Hwang, PhDa, Yun-Cheol Na, PhDc, Heenam Stanley Kim, PhDa

a Department of Biomedical Sciences, Korea University, Seoul, Korea
b Department of Pediatrics, Korea University, Seoul, Korea
c Western Seoul Center, Korea Basic Science Institute, Seoul, Korea

*These authors contributed equally to this work.
Correspondence to Heenam Stanley Kim, PhD

Background
Atopic dermatitis (AD) is a serious global epidemic associated with a modern lifestyle.

Objective
Although aberrant interactions between gut microbes and the intestinal immune system have been implicated in this skin disease, the nature of the microbiome dysfunction underlying the disease remains unclear.

Methods
The gut microbiome from 132 subjects, including 90 patients with AD, was analyzed by using 16S rRNA gene and metagenome sequence analyses. Reference genomes from the Human Microbiome Project and the KEGG Orthology database were used for metagenome analyses. Short-chain fatty acids in fecal samples were compared by using gas chromatographic-mass spectrometric analyses.

Results
We show that enrichment of a subspecies of the major gut species Faecalibacterium prausnitzii is strongly associated with AD. In addition, the AD microbiome was enriched in genes encoding the use of various nutrients that could be released from damaged gut epithelium, reflecting a bloom of auxotrophic bacteria. Fecal samples from patients with AD showed decreased levels of butyrate and propionate, which have anti-inflammatory effects. This is likely a consequence of an intraspecies compositional change in F prausnitzii that reduces the number of high butyrate and propionate producers, including those related to the strain A2-165, a lack of which has been implicated in patients with Crohn disease.

Conclusions
The data suggest that feedback interactions between dysbiosis in F prausnitzii and dysregulation of gut epithelial inflammation might underlie the chronic progression of AD by resulting in impairment of the gut epithelial barrier, which ultimately leads to aberrant TH2-type immune responses to allergens in the skin.

Key words : Atopic dermatitis; gut microbiota; microbiome; dysbiosis; Faecalibacterium prausnitzii

논문정보
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2015년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 10월 (BRIC 등록일 2015-10-05)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Microbiology
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