[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
랩박스 - 형광 이미징의 모든 것
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 한빛사논문 추천논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
이혜옥
이혜옥 (Hae-Ock Lee) 저자 이메일 보기
삼성서울병원, 성균관대학교
저자CV 보기
33 KB
 
조회 2568  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Single-cell mRNA sequencing identifies subclonal heterogeneity in anti-cancer drug responses of lung adenocarcinoma cells
Kyu-Tae Kim1,8,†, Hye Won Lee2,3,7,†, Hae-Ock Lee1,6,†, Sang Cheol Kim1, Yun Jee Seo2,4, Woosung Chung1,7, Hye Hyeon Eum1,8, Do-Hyun Nam2,4,7, Junhyong Kim10,9, Kyeung Min Joo2,5,7* and Woong-Yang Park1,6,7,*

1 Samsung Genome Institute, Samsung Medical Center, Seoul, South Korea 
2 Institute for Refractory Cancer Research, Samsung Medical Center, Seoul, South Korea 
3 Department of Urology, Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University, Seoul, South Korea 
4 Department of Neurosurgery, Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University, Seoul, South Korea 
5 Department of Anatomy and Cell Biology, Sungkyunkwan University, Seoul, South Korea 
6 Department of Molecular Cell Biology, Sungkyunkwan University, Seoul, South Korea 
7 Samsung Advanced Institute for Health Science and Technology (SAIHST), Sungkyunkwan University, Seoul, South Korea 
8 Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Seoul National University, Seoul, South Korea 
9 Department of Biology, University of Pennsylvania, Philadelphia 19104, PA, USA 
10 Penn Program in Single Cell Biology, University of Pennsylvania, Philadelphia 19104, PA, USA 

* Corresponding authors: Kyeung M Joo, Woong-Yang Park
Equal contributors 

Abstract (provisional)
Background Intra-tumoral genetic and functional heterogeneity correlates with cancer clinical prognoses. However, the mechanisms by which intra-tumoral heterogeneity impacts therapeutic outcome remain poorly understood. RNA sequencing (RNA-seq) of single tumor cells can provide comprehensive information about gene expression and single-nucleotide variations in individual tumor cells, which may allow for the translation of heterogeneous tumor cell functional responses into customized anti-cancer treatments. Results We isolated 34 patient-derived xenograft (PDX) tumor cells from a lung adenocarcinoma patient tumor xenograft. Individual tumor cells were subjected to single cell RNA-seq for gene expression profiling and expressed mutation profiling. Fifty tumor-specific SNVs, including KRAS G12D , were observed to be heterogeneous in individual PDX cells. Semi-supervised clustering, based on KRAS G12D mutant expression and a risk score representing expression of 69 lung adenocarcinoma-prognostic genes, classified PDX cells into four groups. PDX cells that survived in vitro anti-cancer drug treatment displayed transcriptome signatures consistent with the group characterized by KRAS G12D and low risk score. Conclusions Single-cell RNA-seq on viable PDX cells identified a candidate tumor cell subgroup associated with anti-cancer drug resistance. Thus, single-cell RNA-seq is a powerful approach for identifying unique tumor cell-specific gene expression profiles which could facilitate the development of optimized clinical anti-cancer strategies. 

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 06월 (BRIC 등록일 2018-07-23)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Biotechnology, Genetics
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
장철순
발표: 장철순 (Princeton University)
일자: 2020년 6월 3일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
접수가 마감되었습니다.
낮은 조도 하에서 금나노클러스터([Au25(Cys)18])에 의한 광촉매 살균 강화 [Nat. Commun.]
황기병
발표: 황기병 (University College Londo...)
일자: 2020년 6월 12일 (금) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
(주)비아이코퍼레이션
관련링크
이혜옥 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Biotechnology

Genetics

외부링크
Google (by Hae-Ock Lee)
Pubmed (by Hae-Ock Lee)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
nanoString(PhileKorea)과 illumina의 Digital Spatial Profiling Seminar에 초대합니다.
[고용부 재직자 무료과정] 바이오/의약분야 계약 및 협상의 이해과정
[고용부 재직자 무료과정] 바이오/의약분야 계약 및 협상의 이해과정
날짜: 2020.06.10~12
장소: 경기도 안양시 동안구 시민대로 401 901 대륭테크노타운15차 9층
[BRIC Webinar]낮은 조도 하에서 금나노클러스터([Au25(Cys)18])에 의한 광촉매 살균 강화 [Nat. Commun.]
Azure Cielo real-time PCR system 런칭 기념 본사 Webinar
SYNTHEGO CRISPR Genom Editing Virtual Seminar
SYNTHEGO CRISPR Genom Editing Virtual Seminar
날짜: 2020.06.17
Online 개최
[BRIC Webinar]코로나바이러스 감염 특성과 코로나바이러스감염증-19의 병인 기전 연구[대한바이러스학회]
[BRIC Webinar]과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
[BRIC Webinar]과당의 지방간 유도 기작과 장내 미생물의 역할[Nature]
사전접수: ~2020.06.02
날짜: 2020.06.03
Online 개최
[오송첨단의료산업진흥재단] 바이오의약품 전문인력 양성교육 2차 교육생 모집
[오송첨단의료산업진흥재단] 바이오의약품 전문인력 양성교육 2차 교육생 모집
사전접수: ~2020.06.12
날짜: 2020.06.22~08.21
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명로 123 오송첨단의료산업진흥재단
2020 제약바이오 분자진단 전문인력 양성과정  공고
2020 제약바이오 분자진단 전문인력 양성과정 공고
사전접수: ~2020.06.14
날짜: 2020.07.08~08.28
장소: 서울과학기술여성새로일하기센터 (강남역 12번 출구) 및 전문기관 교육장
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해 과정
[고용부 재직자 무료과정] 의료기기 GMP의 이해 과정
날짜: 2020.05.27~29
장소: 경기도 성남시 분당구 판교로289번길 20 스타트업캠퍼스 2층 세미나실1
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아