[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
필코리아테크놀로지
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
배양육 연구동향: Meat the Future
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
김진수
김진수 (Jin-Soo Kim) 저자 이메일 보기
서울대학교, 기초과학연구원(IBS)
저자CV 보기
126 KB
  CV updated 2022-05-10 15:31
 
조회 6421  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Digenome-seq: genome-wide profiling of CRISPR-Cas9 off-target effects in human cells

Daesik Kim1,2,8, Sangsu Bae1,2,7,8, Jeongbin Park2, Eunji Kim3, Seokjoong Kim3, Hye Ryeong Yu3, Jinha Hwang4, Jong-Il Kim4.6 & Jin-Soo Kim1,2

1Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science, Seoul, South Korea. 2Department of Chemistry, Seoul National University, Seoul, South Korea. 3ToolGen, Inc., Byucksan Kyoungin Digital Valley 2-Cha, Seoul, South Korea. 4Department of Biomedical Sciences, Seoul National University Graduate School, Seoul, South Korea. 5Department of Biochemistry, Seoul National University College of Medicine, Seoul, South Korea. 6Genomic Medicine Institute (GMI), Medical Research Center, Seoul National University, Seoul, South Korea. 7Present address: Department of Chemistry, Hanyang University, Seoul, South Korea. 8These authors contributed equally to this work.

Correspondence to:  Jin-Soo Kim
 
Abstract
Although RNA-guided genome editing via the CRISPR-Cas9 system is now widely used in biomedical research, genome-wide target specificities of Cas9 nucleases remain controversial. Here we present Digenome-seq, in vitro Cas9-digested whole-genome sequencing, to profile genome-wide Cas9 off-target effects in human cells. This in vitro digest yields sequence reads with the same 5′ ends at cleavage sites that can be computationally identified. We validated off-target sites at which insertions or deletions were induced with frequencies below 0.1%, near the detection limit of targeted deep sequencing. We also showed that Cas9 nucleases can be highly specific, inducing off-target mutations at merely several, rather than thousands of, sites in the entire genome and that Cas9 off-target effects can be avoided by replacing 'promiscuous' single guide RNAs (sgRNAs) with modified sgRNAs. Digenome-seq is a robust, sensitive, unbiased and cost-effective method for profiling genome-wide off-target effects of programmable nucleases including Cas9.

논문정보
TOP5
2015년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 02월 (BRIC 등록일 2015-02-11)
- 연구진: 국내연구진태극기
관련 보도자료
크리스퍼 유전자가위 정확성 높였다...유전질환 및 항암 세포치료제 개발에 활용 기대
기초과학연구원의 유전체교정연구단(단장 김진수)은 서울대 의대(김종일 교수), ㈜툴젠(연구소장 김석중 박사)과의 공동연구를 통해 유전체 교정 도구의 하나인 크리스퍼 유전자가위가 인간세포 내에서 정확히 표적 유전자에만...
생체 내에서 분해/흡수되는 무선 뇌 화학시스템 개발 [Adv. Mater.]
양승민
발표: 양승민 (고려대학교)
일자: 2022년 8월 23일 (화) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
발생 과정에 따른 조혈모세포 세포 외 조절 기전의 변화 [Sci. Adv., ]
이여진
발표: 이여진 (University of Toronto)
일자: 2022년 8월 24일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
아밀로이드-타우 상호작용 모델을 통한 알츠하이머 기전 [Neuron]
이화진
발표: 이화진 (고려대학교, 현 (주)뉴로엑스티)
일자: 2022년 8월 25일 (목) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
단분자 자기 집게 기술(single-molecule magnetic tweezers)을 이용한 당 수송 막 단백질 (GLUT3)의 완전한 접힘 경로 규명[Nat. Chem. Biol.]
이찬우
발표: 이찬우 (서울대학교)
일자: 2022년 9월 5일 (월) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
Mitophagy에서 리소좀 Ca2+ 에 의한 TFEB 활성화 및 ER -> 리소좀 Ca2+ refilling [Autophagy]
이명식
발표: 이명식 (순천향대학교)
일자: 2022년 9월 6일 (화) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
뇌 속 반응성 별세포의 요소회로로 인한 치매 기전 연구 [Cell Metab.]
주연하
발표: 주연하 (한국과학기술연구원, KIST)
일자: 2022년 9월 7일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
다중오믹스-뇌 오가노이드 기반 바이오 융합과학 (Bio-convergence)을 통한 알츠하이머병 환자 하위 군집 발견 및 원인 규명 연구 [Adv. Sci.]
박종찬
발표: 박종찬 (서울대학교 의과대학, University C...)
일자: 2022년 9월 15일 (목) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
수술 후 사망률 예측 인공지능 모델의 다기관 검증연구 [npj Digit. Med.]
이상욱
발표: 이상욱 (울산대학교 의과대학, 서울아산병원)
일자: 2022년 9월 19일 (월) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
대체 스플라이싱 이소형이 Hippo 신호 전달 경로에 미치는 영향 [Nucleic Acids Res.]
최선경
발표: 최선경 (충남대학교 자연과학대학 생화학과)
일자: 2022년 9월 21일 (수) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
관련링크
김진수 님 전체논문보기 >
관련인물
외부링크
ORCID ORCID 0000-0003-4847-1306
Publons Publons M-6918-2013
Lab/개인 홈페이지
Google Scholar
PubMed
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
2022 Korea Advanced Alternative Test Conference 오프라인 개최 안내
2022 Korea Advanced Alternative Test Conference 오프라인 개최 안내
사전접수: ~2022.08.28
날짜: 2022.09.02
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송읍 오송생명1로 194-41 커뮤니케이션 및 벤처연구센터 2층 대회의실, 중회의실 2, 3
이공계 전문기술 연수(석·박사)사업 연수생 추가모집
이공계 전문기술 연수(석·박사)사업 연수생 추가모집
날짜: 2022.08.19
주관: 한국과학기술정보통신부/한국..
SUHF Symposium 2022 (대면·비대면 참석, 현장 점심식사 및 기념품 제공)
SUHF Symposium 2022 (대면·비대면 참석, 현장 점심식사 및 기념품 제공)
사전접수: ~2022.08.24
날짜: 2022.08.27
장소: 아모레퍼시픽 본사 2층 아모레홀 (서울시 용산구 한강대로 100, 신용산역 1·2번출구)
[전액무료] 맞춤형화장품 조제관리과정/LC-MS 운용 재직자 대상 교육생모집
[전액무료] 맞춤형화장품 조제관리과정/LC-MS 운용 재직자 대상 교육생모집
날짜: 2022.08.08~12.31
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송생명1로 194-25, 청주SB플라자
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
진스크립트 광고