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방두희
방두희 (Duhee Bang) 저자 이메일 보기
연세대학교
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182 KB
  CV updated 2019-03-22 10:05
 
조회 4583  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
A high-throughput optomechanical retrieval method for sequence-verified clonal DNA from the NGS platform

Howon Lee1,*, Hyoki Kim2,*, Sungsik Kim1,3, Taehoon Ry1,4, Hwangbeom Kim5, Duhee Bang6 & Sunghoon Kwon1,4,7,8

1 Institutes of Entrepreneurial BioConvergence, Seoul National University, Seoul 151-742, Republic of Korea. 2 Celemics Inc., 371-17, Gasan-dong, Geumcheongu, Seoul 153-718, Republic of Korea. 3 Interdisciplinary Program for Bioengineering, Seoul National University, Seoul 151-744, Republic of Korea. 4 Department of Electrical Engineering and Computer Science, Seoul National University, Seoul 151-744, Republic of Korea. 5 Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, Los Angeles, California 90095-1569, USA. 6 Department of Chemistry, Yonsei University, Seoul 120-749, Republic of Korea. 7 Center for Nanoparticle Research, Institute for Basic Science, Seoul National University, Seoul 151-742, Republic of Korea. 8 Seoul National University Hospital Biomedical Research Institute, 101 Daehakro, Chungrogu, Seoul National University Hospital, Seoul 110-744, Republic of Korea.
* These authors contributed equally to this work.

Correspondence to: Duhee Bang or Sunghoon Kwon
 
Writing DNA plays a significant role in the fields of synthetic biology, functional genomics and bioengineering. DNA clones on next-generation sequencing (NGS) platforms have the potential to be a rich and cost-effective source of sequence-verified DNAs as a precursor for DNA writing. However, it is still very challenging to retrieve target clonal DNA from high-density NGS platforms. Here we propose an enabling technology called ‘Sniper Cloning’ that enables the precise mapping of target clone features on NGS platforms and non-contact rapid retrieval of targets for the full utilization of DNA clones. By merging the three cutting-edge technologies of NGS, DNA microarray and our pulse laser retrieval system, Sniper Cloning is a week-long process that produces 5,188 error-free synthetic DNAs in a single run of NGS with a single microarray DNA pool. We believe that this technology has potential as a universal tool for DNA writing in biological sciences.

논문정보
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2015년 선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 02월 (BRIC 등록일 2015-02-03)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Genetics, Molecular_Biology
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