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백기영
백기영 (Ki Young Paek) 저자 이메일 보기
POSTECH, 현 University of Massachusetts Medical School
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Translation initiation mediated by RNA looping

Ki Young Paeka, Ka Young Honga, Incheol Ryua, Sung Mi Parka, Sun Ju Keuma, Oh Sung Kwona, and Sung Key Janga,b,1

aPOSTECH Biotechnology Center, Department of Life Sciences, and
bDivision of Integrative Biosciences and Biotechnology, Pohang University of Science and Technology, Pohang, Kyungbuk 790-784, Korea

Abstract
Eukaryotic translation initiation commences at the initiation codon near the 5′ end of mRNA by a 40S ribosomal subunit, and the recruitment of a 40S ribosome to an mRNA is facilitated by translation initiation factors interacting with the m7G cap and/or poly(A) tail. The 40S ribosome recruited to an mRNA is then transferred to the AUG initiation codon with the help of translation initiation factors. To understand the mechanism by which the ribosome finds an initiation codon, we investigated the role of eIF4G in finding the translational initiation codon. An artificial polypeptide eIF4G fused with MS2 was localized downstream of the reporter gene through MS2-binding sites inserted in the 3′ UTR of the mRNA. Translation of the reporter was greatly enhanced by the eIF4G-MS2 fusion protein regardless of the presence of a cap structure. Moreover, eIF4G-MS2 tethered at the 3′ UTR enhanced translation of the second cistron of a dicistronic mRNA. The encephalomyocarditis virus internal ribosome entry site, a natural translational-enhancing element facilitating translation through an interaction with eIF4G, positioned downstream of a reporter gene, also enhanced translation of the upstream gene in a cap-independent manner. Finally, we mathematically modeled the effect of distance between the cap structure and initiation codon on the translation efficiency of mRNAs. The most plausible explanation for translational enhancement by the translational-enhancing sites is recognition of the initiation codon by the ribosome bound to the ribosome-recruiting sites through “RNA looping.” The RNA looping hypothesis provides a logical explanation for augmentation of translation by enhancing elements located upstream and/or downstream of a protein-coding region.

RNA looping, translation initiation, ribosome scanning, eukaryotic mRNA
 
1To whom correspondence should be addressed.

Author contributions: K.Y.P., K.Y.H., and S.K.J. designed research; K.Y.P., K.Y.H., I.R., S.M.P., S.J.K., and O.S.K. performed research; K.Y.P., K.Y.H., and S.K.J. analyzed data; and K.Y.P., K.Y.H., and S.K.J. wrote the paper.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 01월 (BRIC 등록일 2015-01-13)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biochemistry
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