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배상수
배상수 (Sangsu Bae) 저자 이메일 보기
서울대학교, 기초과학연구원
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Microhomology-based choice of Cas9 nuclease target sites

Sangsu Bae1,2, Jiyeon Kweon1,2, Heon Seok Kim1,2 & Jin-Soo Kim1,2,*

1Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science, Seoul, South Korea.
2Department of Chemistry, Seoul National University, Seoul, South Korea.

*Correspondence to: Jin-Soo Kim

Programmable nucleases such as Cas9 RNA-guided engineered nucleases (RGENs)1 enable gene knockout in cultured cells and organisms by producing site-specific DNA double-strand breaks, whose repair via error-prone nonhomologous end joining gives rise to small insertions and deletions (indels) at target sites, often causing frameshift mutations in a protein-coding sequence2. The efficiency of this method can be reduced by in-frame mutations via microhomology-mediated end joining3, 4 (Fig. 1a). Here we present a computer program that assists in the choice of Cas9 nuclease, zinc-finger nuclease and transcription activator-like effector nuclease (TALEN) target sites, using microhomology prediction to achieve efficient gene disruption in cell lines and whole organisms.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2014년 06월 (BRIC 등록일 2017-05-16)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics, Biotechnology, Bioinformatics
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
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김윤석
발표: 김윤석 (Stanford University)
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