[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
2019 Bio Top5 인터뷰
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 한빛사논문 추천논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
이일하
이일하 (Ilha Lee) 저자 이메일 보기
서울대학교
조회 3451  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Analysis of Transcription Factor HY5 Genomic Binding Sites Revealed Its Hierarchical Role in Light Regulation of Development
Jungeun Lee 1, Kun He 2, Viktor Stolc 3, Horim Lee 4, Pablo Figueroa 5, Ying Gao 6, Waraporn Tongprasit 7, Hongyu Zhao 8, Ilha Lee 4*, and Xing Wang Deng 6

1 Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, Connecticut 06520-8104; Department of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
2 Peking-Yale Joint Center of Plant Molecular Genetics and Agrobiotechnology, Center for Bioinformatics, National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering and College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, People''s Republic of China
3 Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, Connecticut 06520-8104; Genome Research Facility, NASA Ames Research Center, Moffett Field, California 94035
4 Department of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
5 Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, Connecticut 06520-8104
6 Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, Connecticut 06520-8104; Peking-Yale Joint Center of Plant Molecular Genetics and Agrobiotechnology, Center for Bioinformatics, National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering and College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, People''s Republic of China
7 Eloret Corporation, Sunnyvale, California 94087
8 Department of Epidemiology and Public Health, School of Medicine, Yale University, New Haven, Connecticut 06520.

* To whom correspondence should be addressed.

The transcription factor LONG HYPOCOTYL5 (HY5) acts downstream of multiple families of the photoreceptors and promotes photomorphogenesis. Although it is well accepted that HY5 acts to regulate target gene expression, in vivo binding of HY5 to any of its target gene promoters has yet to be demonstrated. Here, we used a chromatin immunoprecipitation procedure to verify suspected in vivo HY5 binding sites. We demonstrated that in vivo association of HY5 with promoter targets is not altered under distinct light qualities or during light-to-dark transition. Coupled with DNA chip hybridization using a high-density 60-nucleotide oligomer microarray that contains one probe for every 500 nucleotides over the entire Arabidopsis thaliana genome, we mapped genome-wide in vivo HY5 binding sites. This analysis showed that HY5 binds preferentially to promoter regions in vivo and revealed >3000 chromosomal sites as putative HY5 binding targets. HY5 binding targets tend to be enriched in the early light-responsive genes and transcription factor genes. Our data thus support a model in which HY5 is a high hierarchical regulator of the transcriptional cascades for photomorphogenesis.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2007년 03월 (BRIC 등록일 2009-11-17)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Plant Science
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
경제적 의사결정의 개별과정을 동질한 성격의 뉴런으로 구현하기[Neuron]
유승범
발표: 유승범 (University of Minnesota)
일자: 2020년 1월 29일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기
유전자 편집 기술을 활용한 도시농업 적합 작물 개발[Nat. Biotechnol.]
권춘탁
발표: 권춘탁 (Cold Spring Harbor Labor...)
일자: 2020년 2월 19일 (수) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
채권석
발표: 채권석 (경북대학교)
일자: 2020년 2월 6일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
영장류의 실시간 미래 예측과 신경적 기작[Nat. Neurosci.]
유승범
발표: 유승범 (University of Minnesota)
일자: 2020년 2월 12일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
데일리파트너스
관련링크
이일하 님 전체논문보기 >
관련인물
김상희 (극지연구소)
김주현 (서울대학교)
문지현 (서울대학교)
서승석 (Ohio State Univ...)
서은주 (서울대학교)
이정은 (서울대학교, Yale Uni...)
이호림 (서울대학교)
최규하 (포항공과대학교 생명과학과)
현유봉 (Max Planck Inst...)
황현주 (서울대학교)
관련분야 논문보기
Plant Science

외부링크
Google (by Ilha Lee)
Pubmed (by Ilha Lee)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
[BRIC Webinar]동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
사전접수: ~2020.02.05
날짜: 2020.02.06
Online 개최
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
날짜: 2020.03.31
주관: 서경배과학재단
[BRIC Webinar]경제적 의사결정의 개별과정을 동질한 성격의 뉴런으로 구현하기[Neuron]
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
사전접수: ~2020.02.10
날짜: 2020.03.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS