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김진수
김진수 (Jin-Soo Kim) 저자 이메일 보기
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Toward a Functional Annotation of the Human Genome Using Artificial Transcription Factors

Dong-ki Lee, Jin Woo Park, Youn-Jae Kim, Jiwon Kim, Yangsoon Lee, Jeonglim Kim and Jin-Soo Kim1

ToolGen, Inc., Yuseong-gu, Daejeon, South Korea, 305-390

Abstract:
We have developed a novel, high-throughput approach to collecting randomly perturbed gene-expression profiles from the human genome.A human 293 cell library that stably expresses randomly chosen zinc-finger transcription factors was constructed, and the expression profile of each cell line was obtained using cDNA microarray technology.Gene expression profiles from a total of 132 cell lines were collected and analyzed by (1) a simple clustering method based on expression-profile similarity, and (2) the shortest-path analysis method.These analyses identified a number of gene groups, and further investigation revealed that the genes that were grouped together had close biological relationships.The artificial transcription factor-based random genome perturbation method thus provides a novel functional genomic tool for annotation and classification of genes in the human genome and those of many other organisms.

Article and publication are at http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.1397903.

1 Corresponding author. FAX 82-42-863-3840.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2003년 12월 (BRIC 등록일 2004-02-10)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genomics
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