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김진수
김진수 (Jin-Soo Kim) 저자 이메일 보기
서울대학교
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Targeted chromosomal deletions in human cells using zinc finger nucleases
Hyung Joo Lee1,3, Eunji Kim1,3 and Jin-Soo Kim1,2,4

1Department of Chemistry, Seoul National University, Gwanak-gu, Seoul, 151-742, South Korea;
2ToolGen, Inc., Biotechnology Incubating Center, Seoul National University, Gwanak-gu, Seoul, 151-724, South Korea
3 These authors contributed equally to this work.

Abstract
We present a novel approach for generating targeted deletions of genomic segments in human and other eukaryotic cells using engineered zinc finger nucleases (ZFNs). We found that ZFNs designed to target two different sites in a human chromosome could introduce two concurrent DNA double-strand breaks (DSBs) in the chromosome and give rise to targeted deletions of the genomic segment between the two sites. Using this method in human cells, we were able to delete predetermined genomic DNA segments in the range of several-hundred base pairs (bp) to 15 mega-bp at frequencies of 10-3 to 10-1. These high frequencies allowed us to isolate clonal populations of cells, in which the target chromosomal segments were deleted, by limiting dilution. Sequence analysis revealed that many of the deletion junctions contained small insertions or deletions and microhomologies, indicative of DNA repair via nonhomologous end-joining. Unlike other genome engineering tools such as recombinases and meganucleases, ZFNs do not require preinsertion of target sites into the genome and allow precise manipulation of endogenous genomic scripts in animal and plant cells. Thus, ZFN-induced genomic deletions should be broadly useful as a novel method in biomedical research, biotechnology, and gene therapy.

Footnotes
4 Corresponding author.
fax 82-2-874-7455.

[Supplemental material is available online at www.genome.org.]

Article published online before print. Article and publication date are at http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.099747.109.

Received August 18, 2009. Accepted November 3, 2009.
Accepted November 3, 2009.
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2009년 12월 (BRIC 등록일 2015-08-28)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genomics
- 피인용횟수: 120회 이상 인용된 논문
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