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천종식
천종식 (Jongsik Chun) 저자 이메일 보기
서울대학교
 
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EzTaxon: a web-based tool for the identification of prokaryotes based on 16S ribosomal RNA gene sequences
Jongsik Chun1,2, Jae-Hak Lee1, Yoonyoung Jung1, Myungjin Kim2, Seil Kim2, Byung Kwon Kim2 and Young-Woon Lim2
1 Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University, 56-1 Shillim - dong, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea
2 Institute of Biological Sciences School of Microbiology, Seoul National University, 56-1 Shillim - dong, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea in the

Communications
Jongsik Chun

16S rRNA gene sequences commonly have been used for identification of prokaryotes. However, the flood of other types of sequence variants and peer - to-- the input system 16 seconds to review the database of rRNA gene sequence identity to create enough separation difficult and labor-intensive routine. In the current study of all types in our database, prokaryotic rRNA genes contain variants of 16 seconds to create a sequence. The 16S rRNA gene sequence analysis of a Web-based tool called EzTaxon, in order to achieve the identity of the bases Pairwise similarity values and how to Susan's reasoning is based on the separation of HIV has been established. With the development of systems based on the similarity search, multiple sequence alignment and analysis of various paddy provides users of the HIV. With all these features, type of variant 16S rRNA gene sequences in the database successfully detached from the prokaryotic and reliable automation can be used for identification. Free Internet access to the server could EzTaxon http: www.eztaxon.org
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2007년 10월 (BRIC 등록일 2009-11-02)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Microbiology
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
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