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이동기 (Dong-ki Lee) 저자 이메일 보기
성균관대학교
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Phosphorylation of the RNA polymerase II C-terminal domain by TFIIH kinase is not essential for transcription of Saccharomyces cerevisiae genome
Sun Woo Honga,b, Seong Min Honga, Jae Wook Yooa,b, Young Chul Leec, Soyoun Kimd, John T. Lise and Dong-ki Leea,b,1

aGlobal Research Laboratory for RNAi Medicine,
bBK21 School of Chemical Materials Science and Department of Chemistry, Sungkyunkwan University, Suwon 440-746, Korea;
cHormone Research Center, School of Biological Sciences and Technology, Chonnam National University, Gwangju 500-757, Korea;
dDepartment of Biomedical Engineering, Dongguk University, Seoul 100-715, Korea; and
eDepartment of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY 14853

Abstract

Ser-5 phosphorylation of the RNA polymerase II (Pol II) C-terminal domain by TFIIH kinase has been implicated in critical steps in mRNA synthesis, such as Pol II promoter escape and mRNA 5′-capping. However, the general requirement and precise role of TFIIH kinase in Pol II transcription still remain elusive. Here we use a chemical genetics approach to show that, for a majority of budding-yeast genes, specific inhibition of the yeast TFIIH kinase results in a dramatic reduction in both mRNA level and Ser-5 C-terminal domain phosphorylation. Surprisingly, inhibition of TFIIH kinase activity only partially affected both Pol II density and Ser-2 phosphorylation level. The discrepancy between mRNA level and Pol II density is attributed to the defective 5′-capping, which results in the destabilization of mRNAs. Therefore, contrary to the current belief, our study points strongly toward a minor role of TFIIH kinase in Pol II transcription, and a more significant role in mRNA capping in budding yeast.

chemical genetics, Kin28, mRNA capping

Footnotes

1To whom correspondence should be addressed.

Author contributions: S.W.H., J.T.L., and D.-k.L. designed research; S.W.H., S.M.H., and J.W.Y. performed research; Y.C.L. and S.K. contributed new reagents/analytic tools; S.W.H., S.M.H., J.W.Y., J.T.L., and D.-k.L. analyzed data; and S.W.H., J.T.L., and D.-k.L. wrote the paper.

Edited by Jeffrey W. Roberts, Cornell University, Ithaca, NY, and approved July 7, 2009

The authors declare no conflict of interest.

This article is a PNAS Direct Submission.

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2009년 08월 (BRIC 등록일 2009-08-10)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Biochemistry
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