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질문 enzyme cut 에 관해서
궁금녀  | 2006.07.13 15:41
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
TLR 4 polymorphism 에과 한것인데

enzyme cut이 잘 안되서요~~

blood에서 DNA를 추출해서 pcr 과정거친후 DNA는 잘 뽑혔는데

enzyme cut이 잘 안됩니다..

일반적으로 37 도에서 overnight 하는걸로 알고 있는데

enzyme cut할대 특별한 condition이 있음 부탁드립니다.

제가 사용하는 enzyme은 Nco1 (tlr 4 299 ), 와 Hinf1(tlr4 399)입니다.

꼭 좀 부탁드립니다.
#enzyme
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
cloning쟁이  |  2006.07.13    
enzyme cut이 안되는 것은 몇가지 요인이 있는걸로 알고있는데요

우선 enzyme 자체의 활성문제..

그리고 buffer의 문제

또한 methylation의 문제 입니다.


효소의 활성의 경우 두개의 효소를 사용하시니까요

각각으로 잘라봐서 사용하시는 버퍼에서 잘 잘라지는지 cross로 확인해 보아야

합니다.

그리고 버퍼문제는 새거 써보시면 될 것이고요 물론 반응하는 용매(보통 DIW)

의 순도도 중요하겠지요. 가끔 다른건 되는데 안되는 애덜이 있더라고요

끝으로 DNA자체의 문제중 methylation 에 관한것은

enzyme에 대한 정보를 찾아보시면 될듯합니다.

이상 허접한 답변이었습니다.
cloning쟁이  |  2006.07.13    
아참...

그리고 37도에서 밤새 반응하는 시키는 것이 꼭 일반적이지는 않습니다.

경우에 따라서 enzyme 자체가 37도에서 활성이 오래가지 않는 경우도 있고

혹은 특이 조건에서 star활성을 가져서 막 자르고 다니는 경우도 있으니까요.
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