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1.안자른 band는 없나요?
2.DNA양을 줄이고 천천히 전기영동하세요.
3.자른 시료를 전기영동 할때는 vector만 자른것도 전기영동하세요.
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레벨5
BBluee
(일반인)
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23.03.20 15:02
dna prep후 1ul loading한 거예요.
이것은 double digetion 한거구요.
벡터 잘라서 1ul run한 것
젤런을 천천히 해야하는 특별한 이유라도 있을지요?
dna양이 너무 많아서 안잘린 것인지 , pseudo colony라서 그런건지...
- 전기영동 상태가 상당히 안좋으며 끌려서 내려오는 현상은 우선 천천히 내리는 것이 좋습니다.
- 전기영동 사진은 임의로 자르지 말고 gel 전체를 제시하는 것이 좋습니다.
- 전기영동 거리는 항상 일정하게 하는 것이 좋습니다.
- 어떤 marker를 사용하고 gel은 몇%인가요?
- vector 자른거, clone 안자른거, clone 자른거는 같은 gel에서 비교하는 것이 분석하기 용이합니다.
- 현재로서는 vector 1cut, clone 1cut을 해서 분자량 비교를 해 보는 것이 좋을 듯 합니다.
size marker 상단이 10kb일거라 생각되는데 위쪽에 나타난 smear된 band형태의 정체를 알 수 없네요.
7개 lane이 동일한 실험에서 얻은 colony를 길러 plasmid prep한 거라면 서로 사이즈가 상이한것으로 보아 사이즈 큰것 (3, 4, 7)이 insert 되었을 수도 있습니다. 이 경우 one cut 되었거나 enzyme digestion이 전혀 안된것 같습니다.
enzyme digestion할 때 사용하는 plasmide DNA의 양을 줄여야할 것 같아요.
agarose gel 도 잘 굳힌 후 loading한 건지도 확인하시구요.