보통은 staining 후 centrifuge --> washing 순으로 하는데요..

이 과정 스킵하려는 것 인가요?

washing은 많이 해 주어도 큰 문제 없습니다. 

washing - staining - washing 과정으로 실험을 진행하는데요, washing solution과 staining solution volume을 동일시 해줘야 한다고 해서 여기에 대해 궁금증이 생겨 질문드립니다

washing step의 volum은 사실 벽면에 묻어 있는 unbound stain을 제거하기 위한 것이지 volum에 집착하실 필요는 없습니다.  

즉, 조금 더 들어가도 affinity가 떨어지지 않는한은 크게 영향을 주는 과정은 아닙니다.