플라스미드르르 제한효소로 절단해서 agarose gel에서 확인하는 실험은 절단된 플라스미드 밴드의 크기를 보아 맞는 플라스미드인지 확인하는 실험이겠네요.
플라스미드에 여러 종류의 제한효소 자리가 있을겁니다. EcoRI이 아니더라도 다른 제한효소로 잘라서 확인 가능하면 사용하면 되지요. 단, 절단된 제한효소 절편이 잘 분리되고 size marker와 비교해서 각 절편의 크기를 확인할 수 있으면 좋지요.
플라스미드를 one cut했는데, 그 one cut이 plasmid에 EcoRI site가 딱 하나 있다는 말이라면, single band가 나와야 정상입니다.
자른 plasmid와 안자른 plasmid를 옆에 걸어서 비교해 보세요. 그러면 그 두 bands가 안잘린 밴드인지, 일부만 잘려서 잘린 밴드와 안잘린 밴드가 함께 있는 것인지 확인이 됩니다.
그래서 보통 이런 종류의 질문에는 gel 사진을 함께 제시하지요.