[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
다온비에스
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
BioLab 장재봉 교수
전체보기 안전점검 LABox
 전체 > Immunology > Immunoprecipitation
조회 983  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 ChIP PCR 질문
올챙이TMV세균맨(과기인)  | 2022.12.09 10:59

ChIP qPCR을 이제 막 공부하는 중입니다.

제 질문은 ChIP PCR을 하는 이유가 무엇인지 궁금합니다.

 

제가 보는 논문에서 ChIP qPCR은 DNA에 Binding 하는 Protein(Histone이나 Transcription Factor 등)을 Immunoprecipitation으로 제거하고 DNA만을 회수하여 qPCR을 합니다.

 

여기서 궁금한 점은

이미 Protein이 Binding 하는 서열을 알고 있다면 굳이 qPCR로 정량을 할 필요가 있는가? 입니다.

PCR로도 어느 정도 대강 정량이 가능할테고, 그 외에 다른 방법으로도 얼마든지 정량을 할 수 있을텐데 굳이 왜 ChIP을 하는지요?

 

만약 Protein이 Binding 하는 서열을 모른다면 Primer는 어떻게 짤 것인지, Specific 하게 PCR 되는지 어떻게 알 것인지요?

 

 

#ChIP
 
#Immnoprecipitation
 
#PCR
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리BlackSmile  |  2022.12.09   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

일반적으로 ChIP qPCR은 "내가 보고 싶은 target DNA가 얼마나 Protein에 binding하고 있는가?"를 확인할 때 실험을 합니다.

 

Transcription factor와 target gene의 binding을 예로 들자면,

약물을 처리하였을 때 target gene에 binding하는 transcription factor의 양이 늘었는지 줄었는지를 확인하기 위해 ChIP 후 qPCR을 합니다.

Protein이 binding하는 DNA를 모를 경우, ChIP-seq을 진행하여 binding하는 전체 DNA의 sequence를 읽어버릴 수 있습니다.

답변하기
할인행사/신제품신기술 광고 검색광고
모아바이오 모아바이오
[AFG Scientific] *새해맞이* 20% 특가 할인 프로모션! 2만가지이상의 모든 ELISA Kit.. (2.30까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
효율적인 Genome Editing의 필수조건은?
인성크로마텍 인성크로마텍
[Fluidic Analytics] Complex background 에서의 농도(conc.) 및 결합 친화..
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN 한국공인대리점] TECAN Microplate reader/ IMPLEN Nanophotomet.. (4.11까지)
바이오닉스 바이오닉스
[TECAN No.1 한국공식대리점] TECAN NGS 전처리 자동화 System MagicPrep™ 이벤트 (3.4까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
Celloger Series를 사용하여 Live Cell imaging 관찰과 세포 수준의 모든 실험을 처리..
최근등록   더보기 >
최종농도 계산   01.26
HPLC standard 제조 관련 질문드립니다.   01.26
RNA   01.26
첫 cell culture   01.26
Sodium acetate buffer 제조   01.26
골수 그람염색시험시 배양배지   01.26
RM-1 cancer cell line을 구하고 싶습니다.   01.26
rna-seq 분석 HISAT2 에러   01.26
람다파지에서 cos서열에 관해 질문드립니다.   01.26
invasion assay 할때 transwell에 matrigel coating 질문입니...   01.26
최근답변자 우수답변자
대왕개구리SPEED

알석사감옥

개구리지나가는이

앞다리실험은안될때..

대왕개구리강시

알작작해생선

알이뮨프로페셔..

올챙이ddoritos

꽃개구리느림보

개구리빛초롱

개구리flu...

개구리얕은지식

꽃개구리visavis

꽃개구리Ip Man

꽃개구리Kozmoj

개구리ryan

실험관련연재
세오 연재중실전 실험 프로토콜 101
세오 (필명) (Cincinnati Children’s Hospital Medical Center)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
박은총 연재마감후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
Mr.S 연재마감의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재마감실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
이제욱 연재마감생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
필코리아테크놀로지 광고