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질문 마우스 background를 PCR로 간단히 확인 가능한가요?
개구리대학원생인가노예인가(대학원생)  | 2022.12.02 13:34

안녕하세요.

저희 연구실에서 C57BL6과 129라인을 키우고 있는데, 최근 실험결과들을 미루어 볼 때 마우스 라인이 오염되었을 가능성을 생각하고 있습니다.

그래서 마우스 background를 확인하는 방법들을 찾아보니 Jackson lab에서 SNP를 이용하여 확인해 주는 서비스를 제공해 주더라구요.

그런데, 다른 선배들 말을 들어보니 해당 마우스 backgound를 대표하는 PCR primer를 이용하여 PCR을 돌려보면 간단히 확인가능하다는 얘기를 들었습니다.

혹시 이와 관련하여 좀 더 자세히 아시는 분이 계실까요??

저는 C57과 129 마우스 라인에 대해 PCR을 해보고 싶은데, 어떤 프라이머를 사용해야 하는지 잘 모르겠습니다 ㅜㅜ

#background
 
#PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
올챙이텔루르  |  2022.12.06   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

A PCR method for distinguishing cells from mouse strains 129 and C57BL/6 for gene knockout studies Technical Tips Online, Vol. 2, 1997

해당 논문에 나오는 primer 사용해 테스트 해보시는게 어떨까요?

 

같은 B6 strain안에서 더 세부적으로 파악해야하는거면 SNP까지 해야겠지만

B6랑 129 비교하는 것이면 두 strain간 차이가 좀 있긴 해서 꼭 저 primer가 아니더라도 논문 서치 하시면 더 좋은 방법 찾을 수 있을 것 같습니다.

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