실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > Small RNA Analysis
siRNA electrophoresis 실험이 잘 안되네요ㅠ
레벨1 덜덜루밍 (대학원생)
안녕하세요. 저는 polymer base의 nanoparticle을 이용해 siRNA를 delivery하는 실험을 진행중인데요.
이들이 complex를 잘 형성했는지 보기위에 electrophoresis 실험을 현재 하고 있는데 결과가 너무 안나오네요.
저는 현재 Bioneer에서 negative control로 판매하는 FITC labeled siRNA를 이용하고 있으며, agarose gel은 1.5%~3% 모두 해보았습니다. buffer는 TAE buffer를 이용하고 있으며 gel dye로는 eco dye를 이용하고, gel 60ml 기준 eco dye 40ul을 사용합니다. well 하나 당 5ul의 sample을 loading하는데, siRNA는 280ng(10uM 기준 2ul)+loading buffer 2ul + DEPC 1ul을 mix하여 사용합니다. 논문을 따라서 100V에서 20~40min 내려보았는데, ladder는 보이는데 siRNA는 전혀 보이지 않아요... 무엇이 문제일까요?ㅠ 도와주세요..! ㅠㅠ
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