실험 Q&A Microbiology > Bacteria
decarboxylase gene
레벨1 미생물킬러 (대학원생)
안녕하세요
Biogenic amine 관련해서 실험을 하고 있습니다.
새우젓 분리균주를 통해서 시퀀싱 후, 여러 균주 중에 staphylococcus equorum 균주를 선택하여 Biogenic amine 정량 실험을 진행중에 있습니다.
decarboxylase medium 을 통해 정성시험을 거쳐 cadaverine, putrescin, tyramine에서 반응이(노란색ㅡ> 보라색) 일어나는 것을 확인하였습니다.
그래서 이제는 gene이 있는지 pcr를 통해 확인을 하려고 합니다.
그래서 NCBI에서 lysine decarboxylase[staphylococcus equorum] , arginine/lysine/ornithine decarboxylase [Staphylococcus equorum subsp. equorum Mu2] 을 찾았습니다.
제가 궁금한것은.. staphylococcus equorum도 여러 strain이 있는데...species specific한 lysine decarboxylase gene 을 찾는것이 아닌, strian specific lysien decarboxylase gene 을 찾는것이 맞나요...
두번째는, 저렇게 NCBI에서 gene 을 찾았는데 sequence가 protein 형태로 나와있습니다..
세번째는, 만약 저렇게 찾는게 맞다면, decarboxylase gene sequence를 equorum genome sequence과 비교하여 primer를 제작해야되는데,, equorum의 genome sequence는 어떤걸 사용해야되는건가요.. ㅠㅠ
감사합니다..
Bio마켓 프리미엄