뭐에 쓰는 프로브 프라이머 올리고머인지 알아야 뭐라도 답글이 달리지 않을까요?
예를 들어 올리고머란 말은 단순히 그냥 중합체란 단어인데,
이 구성 요소가 뭐냐에 따라 단백질일 수도 있고 핵산일 수도 있습니다.
단어의 개념을 정리하고 좀 더 자세히 질문글을 쓰는 게 좋겠습니다.
- mutation 용이면 mutation 길이에 따라 달라집니다.
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22.08.31 14:02
뭐에 쓰는 프로브 프라이머 올리고머인지 알아야 뭐라도 답글이 달리지 않을까요?
-> 앗 죄송합니다. Mutant detect 을 위해 ddPCR을 진행하고자 합니다.
하기전에 TP53 p.Q331fs Mutant oligomer 와 WT oligomer, 해당 Oligomer 들에 해당하는 probe과 primer 들을 제작하려고 합니다.
Probe 와 Primer 를 제작할때 MUT 및 WT Oligomer sequence가 있어야 하더라구요.
그래서 MUT 및 WT Oligomer sequece를 짤때, 길이를 얼마나 짜야하는지, Probe 이나 Primer 짤때처럼 조건들이 있는지 궁금합니다..!
WT Oligomer 는 변이가 일어난 부분이 포함된 TP53 reference sequence로 짤 예정이고 MUT Oligomer 는 WT Oligomer 에서 변이가된 sequence로 짤 예정입니다.
그 변이부분 포함하여 앞 뒤로 어느정도 길이로 짜야하는지
앞뒤로 길이가 똑같아야 하는건지
길게 짤수록 좋은건지
해서요.. 선생님 도움주시면 감사하겠습니다..
https://www.bio-rad.com/ko-kr/life-science/learning-center/introduction-to-digital-pcr/planning-ddpcr-experiments?ID=MDV33OKG4
저도 ddPCR은 안해봤는데 바이오라드사 프로토콜엔 75~200bp짜리 template쓰는 걸 추천한다고 돼 있네요.
근데 이걸 왜 하는 거에요? 프로브를 바로 안 쓰고 굳이 테스트해야 할 이유가 있습니까?
누가 시켜서 하는 건지 아니면 본인이 생각하고 하시는 건지는 모르겠지만 이걸 위해
세포나 조직, 생물 갈아서 얻은 template가 아니라 oligomer를 굳이 따로 합성해서
테스트를 해야 할 필요가 있나 궁금하네요.
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22.09.01 17:10
근데 이걸 왜 하는 거에요? 프로브를 바로 안 쓰고 굳이 테스트해야 할 이유가 있습니까?
누가 시켜서 하는 건지 아니면 본인이 생각하고 하시는 건지는 모르겠지만 이걸 위해
세포나 조직, 생물 갈아서 얻은 template가 아니라 oligomer를 굳이 따로 합성해서
테스트를 해야 할 필요가 있나 궁금하네요.
-> 아 이렇게 하라고해서 진행을 하고있는거긴 한데요.
검체가 충분하지 않아서 Oligomer로 먼저 테스트 해서 조건을 잡으려고 합니다.