[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
이엔셀
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
Miami Winter Symposium 2023 – Molecular Neuroscience: Focus on Sensory Disorders 학회 참관기
전체보기 안전점검 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > etc.
조회 555  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 size가 큰 플라스미드 전기영동 방법
알qkqh1(대학생)  | 2022.08.24 17:20

안녕하세요, 실험을 배워나가고 있는 학부생입니다.

cloning과 관련해서 이곳에 몇 번 질문을 남긴 적이 있었는데, 마침내 cloning이 최종적으로 성공한 것 같습니다. 그런데, insert1은 sequencing을 통해 삽입하였지만 insert2는 확인하지 못해 확인 과정이 필요합니다. 이를 위해서 원래는 colony PCR이나 제한효소 처리를 통해 insert가 분리되는지 관찰하고 있습니다. 그런데 이번에는 처음 vector에도 같은 항생제 저항 유전자가 들어있고, 또 무엇보다 형질전환 colony가 너무 많이 떠 제가 찾는 플라스미드를 찾는데 시간이 많이 소요될 듯 합니다. 그래서 size로 1차적으로 거르기 위해 전기영동을 하려 하였는데, 실험실에 계시는 분이 알려주시기로 저희 실험실 전기영동 기계는 5000bp이상의 플라스미드는 잘 분리가 되지 않는다고 합니다. 전기영동의 원리를 생각해보면 agarose gel의 농도를 높이면 괜찮을 것 같은데, 제 생각이 맞을까요? 아니면 혹시 제가 선택할 수 있는 다른 방법이 있을까요?

#전기영동
 
#플라스미드
 
#size
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2022.08.24   

- 큰 plasmid 기준이 뭔가요?

 

- 전기영동의 원리를 생각해보면 agarose gel의 농도를 높이면 괜찮을 것

같은데

: gel %를 내리면 됩니다.

개구리clickclick  |  2022.08.24   

colony plate 뒷 면에 점을 찍어서 번호를 새기고 

1차 거르는(?) 방법으로로 colony pcr을 해 보면 어떨까요? 

 

그래서 해당 insert 가 pcr 되는 것만 

enzyme cutting해서 확인해 보면 좋을 것 같은데, 

 

plasmid 단일 컷 하면 size보기가 좋지만;;; 
그래도 어짜피 효소를 쳐야하니깐 plasmid를 뽑아야 되잖아요? 

1차로 colony 살짝 찍어서 pcr로 screening 하는 게 좋겠어요. 

알qkqh1  |  2022.08.24   

네, 분리해야 하는 플라스미드가 각각 6000, 6500bp 정도 됩니다. 많이 큰 편은 아니지만 저희 실험실 기계로는 분리가 어려워서 크다고 적었습니다. 플라스미드 프랩은 해놓은 상태인데, pcr을 돌리는 것은 시간이 너무 오래 걸리고 무엇보다 enzyme cut한 부위가 프라이머 결합부위라 프라이머 주문부터 기다려야 할 것 같아 다른 방법을 찾아보는 중이었습니다. 

대왕개구리SPEED  |  2022.08.24   

- 그 정도 크기는 일반적인 크기이고 일반 전기영동조로도 충분히 분리됩니다.

 

- 제한효소로 잘라서 확인하면 됩니다.

답변하기
할인행사/신제품신기술 광고 검색광고
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
최대 800개 유전자 발현량을 동시에 확인할 수 있는 nanoString nCounter SPRINT SAL.. (12.31까지)
코람바이오텍 코람바이오텍
Antibody 할인 - Cell Signaling Technology, Santa Cruz, Protein.. (4.25까지)
마이크로젠타스 마이크로젠타스
[ExoCAS-2™] 샘플에서부터 엑소좀 까지 고농도 고순도 고회수율로 추출해주는 Exosome Isolat..
이츠바이오 이츠바이오
[abm] PCR Products 1+1 및 20% 할인 행사!! (4.28까지)
인성크로마텍 인성크로마텍
[BQC] 산화 스트레스(Oxidative Stress) 분석 / 세포 분석 / 조직 염색 키트 20% 할인 (4.28까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
Spatial Transctiptome 분석 Tumor Microenvironment(TME) 연구의 새로운..
최근등록   더보기 >
Trypton,pepton   03.24
메탄올 용매 용해 독성   03.24
cloning 실험하는데 dna 몇 최소 ng 있어야 사용가능한가요?   03.24
blue-white screening 실험에서 전기영동을 하는 이유가 뭔가요?   03.24
40% 아크릴아마이드를 30%아크릴아마이드로 농도를 낮추고 싶습니다.   03.24
PCR전기영동 분석   03.24
논문 투고시 저자 이름, 이메일 대해 질문 드립니다.   03.24
MTT 실험 시 사균처리   03.24
부레옥잠에서 사포닌 추출   03.24
PCR기계   03.24
최근답변자 우수답변자
대왕개구리SPEED

개구리실험조아

알enen

알나는야학부생

알Choip

알친절하게살자

개구리새슬

개구리clickclick

꽃개구리느림보

꽃개구리TX

개구리secu

개구리propadrum

개구리ryan

개구리flu...

개구리현직백수

개구리곰돌2

실험관련연재
세오 연재중실전 실험 프로토콜 101
세오 (필명) (Cincinnati Children’s Hospital Medical Center)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
박은총 연재마감후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
Mr.S 연재마감의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재마감실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
이제욱 연재마감생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
필코리아테크놀로지 광고