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 전체 > Molecular Biology-DNA > Gene Cloning
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질문 transgenic zebrafish의 gene을 clonig 할 때 cDNA 사용
알근당근당(대학생)  | 08.05 14:54

안녕하세요.

현재 zebrafish를 double knockout 해서 만들어져있고, 

이때 RNA-seq결과로 나온 특정 유전자들에 대해서 cloming을 하려고 합니다.

 

그런데 이때 cloning을 하려면 cDNA를 어떤 것으로 사용해야 될까요?

 

두 유전자가 a, b라고 한다면

wild type   ,    a-/-    ,    b-/-    ,     a+/-,b+/-     ,    a-/-,b-/- 

cDNA 나 knockout 한 model에 대해서 개념이 헷갈려서 

어떤 것의 cDNA를 사용하여 target gene을 뽑아야 되는지 모르겠습니다

도움 부탁드립니다!

#cDNA
 
#cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리크옷  |  08.08 04:27  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

>  두 유전자가 a, b라고 한다면

> wild type   ,    a-/-    ,    b-/-    ,     a+/-,b+/-     ,    a-/-,b-/- 

> cDNA 나 knockout 한 model에 대해서 개념이 헷갈려서 어떤 것의 cDNA를 사용하여 target gene을 뽑아야 되는지 모르겠습니다

기능이 살아있는 (functional) a, b 유전자의 cDNA 를 클로닝 하는 것이 목적이라면 우선 a-/-, b-/-, 또는 a-/-, b-/- 는 쓰면 안 되겠네요.  a+/-,b+/- 라면 PCR 같은 것을 했을 때 기능이 살아있는 allele 과 knockout allele 이 같이 잡힐 수도 있겠으니, wild type 을 쓰는 것이 가장 안전하리라 생각합니다. 

a, b 유전자가 아닌 다른, 예를 들어 RNA-seq 결과를 보고 선택하신, 유전자의 cDNA 를 클로닝하신다면, 이론적으로는 어떤 것을 선택해도 상관이 없겠습니다.  아마 RNA-seq 결과에서 발현량이 높았던 strain 을 쓰시면, 예를 들어 reverse transcription 에 의해 cloning 하실 때 클로닝이 조금 더 쉬울 수도 있겠네요.  

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