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그림이 어떤 논문에서 나왔는지와 그림 legend 를 같이 올려주시면 이해하기가 쉬울 것 같네요.
혹시 scRNA-seq 결과에서 나온 그림이라면 y 축의 identity 가 일종의 클러스터이고, 각 클러스터에 속한 cell 들 중 해당 유전자를 발현하는 세포의 percentage ... 가 아닐까 짐작해봅니다.
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레벨2
rlatmddus
(대학생)
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22.08.03 09:26
크옷님 감사합니다!
유전자 expression dot plot에 대해 알아보다가 구글에서 찾은 이미지 입니다!
average expression은 평균 유전자 발현 정도(강도?) 이고 percent expression은 전체 cell 중 해당 유전자가 발현하는 % 비율이면
average expression은 높은데 percent expressed는 낮은 경우는
평균 유전자.발현 정도(세기는)는 강한데 전체 cell중에 유전자가 발현되는 비율 자체는 낮다.가 맞을까요?
> average expression은 높은데 percent expressed는 낮은 경우는
평균 유전자.발현 정도(세기는)는 강한데 전체 cell중에 유전자가 발현되는 비율 자체는 낮다.가 맞을까요?
정확한 것은 figure legend 를 봐야 알겠습니다만, 제가 위에서 짐작한 것이 맞다면, 예 맞습니다.
평균 유전자 발현 정도를 유전자 발현이 발견되는 세포들 중에서만 계산했을 수도 있습니다. 아니라면 percent expressed 가 낮고 average expression 은 높은 경우가 나오기 힘드리라 생각합니다. 정확한 것은 figure legend 에 ...